Protein–RNA interactions for Protein: Q8WTW3

COG1, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG1Q8WTW3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COG1Q8WTW3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COG1Q8WTW3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COG1Q8WTW3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COG1Q8WTW3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COG1Q8WTW3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COG1Q8WTW3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COG1Q8WTW3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COG1Q8WTW3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COG1Q8WTW3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COG1Q8WTW3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COG1Q8WTW3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
COG1Q8WTW3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
COG1Q8WTW3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COG1Q8WTW3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
COG1Q8WTW3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
COG1Q8WTW3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
COG1Q8WTW3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
COG1Q8WTW3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
COG1Q8WTW3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
COG1Q8WTW3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
COG1Q8WTW3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
COG1Q8WTW3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COG1Q8WTW3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COG1Q8WTW3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COG1Q8WTW3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COG1Q8WTW3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COG1Q8WTW3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COG1Q8WTW3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COG1Q8WTW3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COG1Q8WTW3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COG1Q8WTW3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COG1Q8WTW3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COG1Q8WTW3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
COG1Q8WTW3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
COG1Q8WTW3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
COG1Q8WTW3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
COG1Q8WTW3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COG1Q8WTW3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
COG1Q8WTW3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COG1Q8WTW3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
COG1Q8WTW3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COG1Q8WTW3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COG1Q8WTW3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
COG1Q8WTW3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COG1Q8WTW3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COG1Q8WTW3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
COG1Q8WTW3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COG1Q8WTW3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COG1Q8WTW3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
COG1Q8WTW3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COG1Q8WTW3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COG1Q8WTW3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COG1Q8WTW3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COG1Q8WTW3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COG1Q8WTW3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COG1Q8WTW3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COG1Q8WTW3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COG1Q8WTW3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COG1Q8WTW3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COG1Q8WTW3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COG1Q8WTW3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COG1Q8WTW3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COG1Q8WTW3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COG1Q8WTW3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COG1Q8WTW3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COG1Q8WTW3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COG1Q8WTW3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COG1Q8WTW3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COG1Q8WTW3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COG1Q8WTW3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COG1Q8WTW3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COG1Q8WTW3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COG1Q8WTW3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
COG1Q8WTW3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
COG1Q8WTW3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
COG1Q8WTW3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
COG1Q8WTW3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
COG1Q8WTW3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
COG1Q8WTW3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
COG1Q8WTW3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
COG1Q8WTW3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
COG1Q8WTW3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
COG1Q8WTW3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
COG1Q8WTW3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COG1Q8WTW3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COG1Q8WTW3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COG1Q8WTW3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COG1Q8WTW3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COG1Q8WTW3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COG1Q8WTW3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COG1Q8WTW3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COG1Q8WTW3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COG1Q8WTW3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COG1Q8WTW3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COG1Q8WTW3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COG1Q8WTW3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
COG1Q8WTW3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COG1Q8WTW3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
COG1Q8WTW3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 3379.4 ms