Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEY7

USP33, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 33, humanhuman

Predictions only

Length 942 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP33Q8TEY7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP33Q8TEY7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP33Q8TEY7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP33Q8TEY7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP33Q8TEY7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP33Q8TEY7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP33Q8TEY7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP33Q8TEY7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP33Q8TEY7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP33Q8TEY7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP33Q8TEY7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP33Q8TEY7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP33Q8TEY7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
USP33Q8TEY7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP33Q8TEY7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP33Q8TEY7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP33Q8TEY7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP33Q8TEY7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP33Q8TEY7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP33Q8TEY7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP33Q8TEY7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP33Q8TEY7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
USP33Q8TEY7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP33Q8TEY7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP33Q8TEY7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP33Q8TEY7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP33Q8TEY7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
USP33Q8TEY7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP33Q8TEY7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP33Q8TEY7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
USP33Q8TEY7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP33Q8TEY7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP33Q8TEY7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP33Q8TEY7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
USP33Q8TEY7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP33Q8TEY7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP33Q8TEY7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP33Q8TEY7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP33Q8TEY7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP33Q8TEY7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP33Q8TEY7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP33Q8TEY7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP33Q8TEY7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP33Q8TEY7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP33Q8TEY7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
USP33Q8TEY7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP33Q8TEY7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP33Q8TEY7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
USP33Q8TEY7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
USP33Q8TEY7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP33Q8TEY7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP33Q8TEY7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP33Q8TEY7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP33Q8TEY7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP33Q8TEY7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP33Q8TEY7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP33Q8TEY7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP33Q8TEY7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP33Q8TEY7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP33Q8TEY7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP33Q8TEY7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP33Q8TEY7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP33Q8TEY7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP33Q8TEY7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP33Q8TEY7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP33Q8TEY7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP33Q8TEY7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP33Q8TEY7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP33Q8TEY7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP33Q8TEY7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
USP33Q8TEY7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP33Q8TEY7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP33Q8TEY7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP33Q8TEY7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP33Q8TEY7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP33Q8TEY7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP33Q8TEY7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP33Q8TEY7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP33Q8TEY7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP33Q8TEY7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP33Q8TEY7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP33Q8TEY7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP33Q8TEY7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP33Q8TEY7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP33Q8TEY7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP33Q8TEY7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
USP33Q8TEY7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP33Q8TEY7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP33Q8TEY7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP33Q8TEY7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP33Q8TEY7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP33Q8TEY7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP33Q8TEY7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP33Q8TEY7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
USP33Q8TEY7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP33Q8TEY7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP33Q8TEY7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP33Q8TEY7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP33Q8TEY7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP33Q8TEY7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8 ms