Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDY3

ACTRT2, Actin-related protein T2, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTRT2Q8TDY3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACTRT2Q8TDY3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACTRT2Q8TDY3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ACTRT2Q8TDY3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACTRT2Q8TDY3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACTRT2Q8TDY3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACTRT2Q8TDY3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACTRT2Q8TDY3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACTRT2Q8TDY3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACTRT2Q8TDY3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACTRT2Q8TDY3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACTRT2Q8TDY3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACTRT2Q8TDY3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACTRT2Q8TDY3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACTRT2Q8TDY3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACTRT2Q8TDY3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACTRT2Q8TDY3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACTRT2Q8TDY3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACTRT2Q8TDY3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACTRT2Q8TDY3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACTRT2Q8TDY3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACTRT2Q8TDY3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACTRT2Q8TDY3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACTRT2Q8TDY3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACTRT2Q8TDY3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACTRT2Q8TDY3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACTRT2Q8TDY3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACTRT2Q8TDY3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ACTRT2Q8TDY3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ACTRT2Q8TDY3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ACTRT2Q8TDY3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACTRT2Q8TDY3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ACTRT2Q8TDY3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACTRT2Q8TDY3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACTRT2Q8TDY3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACTRT2Q8TDY3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACTRT2Q8TDY3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACTRT2Q8TDY3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACTRT2Q8TDY3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACTRT2Q8TDY3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACTRT2Q8TDY3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ACTRT2Q8TDY3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACTRT2Q8TDY3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACTRT2Q8TDY3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACTRT2Q8TDY3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ACTRT2Q8TDY3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACTRT2Q8TDY3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACTRT2Q8TDY3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACTRT2Q8TDY3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACTRT2Q8TDY3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACTRT2Q8TDY3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACTRT2Q8TDY3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACTRT2Q8TDY3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACTRT2Q8TDY3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACTRT2Q8TDY3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACTRT2Q8TDY3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACTRT2Q8TDY3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACTRT2Q8TDY3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACTRT2Q8TDY3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACTRT2Q8TDY3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACTRT2Q8TDY3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACTRT2Q8TDY3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ACTRT2Q8TDY3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ACTRT2Q8TDY3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ACTRT2Q8TDY3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ACTRT2Q8TDY3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ACTRT2Q8TDY3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ACTRT2Q8TDY3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ACTRT2Q8TDY3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ACTRT2Q8TDY3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ACTRT2Q8TDY3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACTRT2Q8TDY3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACTRT2Q8TDY3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACTRT2Q8TDY3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACTRT2Q8TDY3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACTRT2Q8TDY3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACTRT2Q8TDY3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACTRT2Q8TDY3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ACTRT2Q8TDY3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACTRT2Q8TDY3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACTRT2Q8TDY3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACTRT2Q8TDY3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACTRT2Q8TDY3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACTRT2Q8TDY3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACTRT2Q8TDY3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACTRT2Q8TDY3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACTRT2Q8TDY3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACTRT2Q8TDY3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ACTRT2Q8TDY3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ACTRT2Q8TDY3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ACTRT2Q8TDY3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACTRT2Q8TDY3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACTRT2Q8TDY3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACTRT2Q8TDY3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACTRT2Q8TDY3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACTRT2Q8TDY3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACTRT2Q8TDY3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACTRT2Q8TDY3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACTRT2Q8TDY3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ACTRT2Q8TDY3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85 ms