Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDG4

HELQ, Helicase POLQ-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELQQ8TDG4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HELQQ8TDG4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HELQQ8TDG4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HELQQ8TDG4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
HELQQ8TDG4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HELQQ8TDG4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HELQQ8TDG4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
HELQQ8TDG4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HELQQ8TDG4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HELQQ8TDG4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HELQQ8TDG4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HELQQ8TDG4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HELQQ8TDG4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HELQQ8TDG4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HELQQ8TDG4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HELQQ8TDG4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HELQQ8TDG4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HELQQ8TDG4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HELQQ8TDG4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HELQQ8TDG4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HELQQ8TDG4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HELQQ8TDG4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HELQQ8TDG4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HELQQ8TDG4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HELQQ8TDG4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HELQQ8TDG4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HELQQ8TDG4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HELQQ8TDG4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HELQQ8TDG4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HELQQ8TDG4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HELQQ8TDG4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HELQQ8TDG4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HELQQ8TDG4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HELQQ8TDG4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HELQQ8TDG4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HELQQ8TDG4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HELQQ8TDG4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HELQQ8TDG4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HELQQ8TDG4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HELQQ8TDG4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HELQQ8TDG4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HELQQ8TDG4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HELQQ8TDG4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HELQQ8TDG4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HELQQ8TDG4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HELQQ8TDG4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HELQQ8TDG4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
HELQQ8TDG4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
HELQQ8TDG4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HELQQ8TDG4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HELQQ8TDG4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HELQQ8TDG4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HELQQ8TDG4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HELQQ8TDG4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HELQQ8TDG4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HELQQ8TDG4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HELQQ8TDG4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HELQQ8TDG4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HELQQ8TDG4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HELQQ8TDG4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
HELQQ8TDG4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HELQQ8TDG4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HELQQ8TDG4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HELQQ8TDG4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HELQQ8TDG4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HELQQ8TDG4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HELQQ8TDG4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HELQQ8TDG4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HELQQ8TDG4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HELQQ8TDG4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HELQQ8TDG4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HELQQ8TDG4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HELQQ8TDG4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HELQQ8TDG4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HELQQ8TDG4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HELQQ8TDG4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
HELQQ8TDG4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HELQQ8TDG4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HELQQ8TDG4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HELQQ8TDG4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HELQQ8TDG4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HELQQ8TDG4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HELQQ8TDG4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HELQQ8TDG4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HELQQ8TDG4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HELQQ8TDG4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HELQQ8TDG4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HELQQ8TDG4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HELQQ8TDG4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
HELQQ8TDG4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HELQQ8TDG4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HELQQ8TDG4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HELQQ8TDG4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HELQQ8TDG4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HELQQ8TDG4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HELQQ8TDG4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HELQQ8TDG4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
HELQQ8TDG4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HELQQ8TDG4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HELQQ8TDG4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms