Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
LMO3Q8TAP4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LMO3Q8TAP4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LMO3Q8TAP4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LMO3Q8TAP4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LMO3Q8TAP4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LMO3Q8TAP4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LMO3Q8TAP4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
LMO3Q8TAP4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LMO3Q8TAP4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LMO3Q8TAP4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMO3Q8TAP4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMO3Q8TAP4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMO3Q8TAP4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMO3Q8TAP4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMO3Q8TAP4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMO3Q8TAP4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMO3Q8TAP4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMO3Q8TAP4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMO3Q8TAP4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMO3Q8TAP4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMO3Q8TAP4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMO3Q8TAP4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LMO3Q8TAP4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LMO3Q8TAP4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LMO3Q8TAP4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LMO3Q8TAP4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMO3Q8TAP4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMO3Q8TAP4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMO3Q8TAP4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMO3Q8TAP4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMO3Q8TAP4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMO3Q8TAP4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LMO3Q8TAP4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LMO3Q8TAP4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LMO3Q8TAP4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
LMO3Q8TAP4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMO3Q8TAP4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMO3Q8TAP4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMO3Q8TAP4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
LMO3Q8TAP4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMO3Q8TAP4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMO3Q8TAP4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMO3Q8TAP4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMO3Q8TAP4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMO3Q8TAP4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMO3Q8TAP4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMO3Q8TAP4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMO3Q8TAP4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMO3Q8TAP4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMO3Q8TAP4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMO3Q8TAP4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMO3Q8TAP4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMO3Q8TAP4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMO3Q8TAP4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMO3Q8TAP4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMO3Q8TAP4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
LMO3Q8TAP4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMO3Q8TAP4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMO3Q8TAP4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LMO3Q8TAP4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LMO3Q8TAP4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LMO3Q8TAP4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LMO3Q8TAP4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LMO3Q8TAP4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
LMO3Q8TAP4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LMO3Q8TAP4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LMO3Q8TAP4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LMO3Q8TAP4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LMO3Q8TAP4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
LMO3Q8TAP4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
LMO3Q8TAP4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMO3Q8TAP4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMO3Q8TAP4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMO3Q8TAP4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMO3Q8TAP4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMO3Q8TAP4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMO3Q8TAP4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMO3Q8TAP4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMO3Q8TAP4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMO3Q8TAP4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMO3Q8TAP4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMO3Q8TAP4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMO3Q8TAP4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMO3Q8TAP4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMO3Q8TAP4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMO3Q8TAP4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
LMO3Q8TAP4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMO3Q8TAP4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
LMO3Q8TAP4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMO3Q8TAP4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMO3Q8TAP4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMO3Q8TAP4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMO3Q8TAP4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMO3Q8TAP4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMO3Q8TAP4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMO3Q8TAP4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMO3Q8TAP4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMO3Q8TAP4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMO3Q8TAP4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms