Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RPAP2Q8IXW5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RPAP2Q8IXW5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RPAP2Q8IXW5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RPAP2Q8IXW5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
RPAP2Q8IXW5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
RPAP2Q8IXW5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
RPAP2Q8IXW5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
RPAP2Q8IXW5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
RPAP2Q8IXW5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
RPAP2Q8IXW5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
RPAP2Q8IXW5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
RPAP2Q8IXW5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
RPAP2Q8IXW5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
RPAP2Q8IXW5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
RPAP2Q8IXW5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
RPAP2Q8IXW5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
RPAP2Q8IXW5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
RPAP2Q8IXW5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
RPAP2Q8IXW5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
RPAP2Q8IXW5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
RPAP2Q8IXW5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
RPAP2Q8IXW5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
RPAP2Q8IXW5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
RPAP2Q8IXW5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
RPAP2Q8IXW5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
RPAP2Q8IXW5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RPAP2Q8IXW5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RPAP2Q8IXW5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RPAP2Q8IXW5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
RPAP2Q8IXW5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
RPAP2Q8IXW5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
RPAP2Q8IXW5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RPAP2Q8IXW5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RPAP2Q8IXW5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RPAP2Q8IXW5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RPAP2Q8IXW5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RPAP2Q8IXW5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RPAP2Q8IXW5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
RPAP2Q8IXW5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RPAP2Q8IXW5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RPAP2Q8IXW5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RPAP2Q8IXW5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RPAP2Q8IXW5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RPAP2Q8IXW5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
RPAP2Q8IXW5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RPAP2Q8IXW5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
RPAP2Q8IXW5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
RPAP2Q8IXW5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
RPAP2Q8IXW5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
RPAP2Q8IXW5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
RPAP2Q8IXW5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
RPAP2Q8IXW5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
RPAP2Q8IXW5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
RPAP2Q8IXW5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
RPAP2Q8IXW5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
RPAP2Q8IXW5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RPAP2Q8IXW5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
RPAP2Q8IXW5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
RPAP2Q8IXW5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RPAP2Q8IXW5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RPAP2Q8IXW5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RPAP2Q8IXW5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
RPAP2Q8IXW5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RPAP2Q8IXW5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
RPAP2Q8IXW5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
RPAP2Q8IXW5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RPAP2Q8IXW5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RPAP2Q8IXW5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
RPAP2Q8IXW5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
RPAP2Q8IXW5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
RPAP2Q8IXW5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
RPAP2Q8IXW5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
RPAP2Q8IXW5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
RPAP2Q8IXW5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
RPAP2Q8IXW5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
RPAP2Q8IXW5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
RPAP2Q8IXW5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
RPAP2Q8IXW5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
RPAP2Q8IXW5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
RPAP2Q8IXW5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
RPAP2Q8IXW5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
RPAP2Q8IXW5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
RPAP2Q8IXW5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
RPAP2Q8IXW5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
RPAP2Q8IXW5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
RPAP2Q8IXW5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
RPAP2Q8IXW5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
RPAP2Q8IXW5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
RPAP2Q8IXW5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
RPAP2Q8IXW5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RPAP2Q8IXW5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RPAP2Q8IXW5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
RPAP2Q8IXW5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
RPAP2Q8IXW5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
RPAP2Q8IXW5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RPAP2Q8IXW5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RPAP2Q8IXW5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
RPAP2Q8IXW5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RPAP2Q8IXW5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms