Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVT5

KSR1, Kinase suppressor of Ras 1, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KSR1Q8IVT5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KSR1Q8IVT5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KSR1Q8IVT5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KSR1Q8IVT5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KSR1Q8IVT5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KSR1Q8IVT5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KSR1Q8IVT5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KSR1Q8IVT5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KSR1Q8IVT5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
KSR1Q8IVT5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
KSR1Q8IVT5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KSR1Q8IVT5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KSR1Q8IVT5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KSR1Q8IVT5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KSR1Q8IVT5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KSR1Q8IVT5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KSR1Q8IVT5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KSR1Q8IVT5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KSR1Q8IVT5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
KSR1Q8IVT5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KSR1Q8IVT5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KSR1Q8IVT5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KSR1Q8IVT5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KSR1Q8IVT5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KSR1Q8IVT5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KSR1Q8IVT5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KSR1Q8IVT5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KSR1Q8IVT5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KSR1Q8IVT5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KSR1Q8IVT5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KSR1Q8IVT5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KSR1Q8IVT5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KSR1Q8IVT5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KSR1Q8IVT5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KSR1Q8IVT5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KSR1Q8IVT5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KSR1Q8IVT5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KSR1Q8IVT5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KSR1Q8IVT5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KSR1Q8IVT5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KSR1Q8IVT5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KSR1Q8IVT5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KSR1Q8IVT5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KSR1Q8IVT5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KSR1Q8IVT5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KSR1Q8IVT5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KSR1Q8IVT5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KSR1Q8IVT5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KSR1Q8IVT5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
KSR1Q8IVT5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
KSR1Q8IVT5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KSR1Q8IVT5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
KSR1Q8IVT5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KSR1Q8IVT5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KSR1Q8IVT5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
KSR1Q8IVT5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KSR1Q8IVT5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
KSR1Q8IVT5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
KSR1Q8IVT5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KSR1Q8IVT5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KSR1Q8IVT5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KSR1Q8IVT5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KSR1Q8IVT5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KSR1Q8IVT5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KSR1Q8IVT5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KSR1Q8IVT5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KSR1Q8IVT5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KSR1Q8IVT5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KSR1Q8IVT5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
KSR1Q8IVT5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KSR1Q8IVT5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KSR1Q8IVT5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KSR1Q8IVT5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KSR1Q8IVT5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KSR1Q8IVT5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KSR1Q8IVT5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KSR1Q8IVT5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KSR1Q8IVT5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KSR1Q8IVT5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KSR1Q8IVT5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
KSR1Q8IVT5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KSR1Q8IVT5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KSR1Q8IVT5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KSR1Q8IVT5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KSR1Q8IVT5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KSR1Q8IVT5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KSR1Q8IVT5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KSR1Q8IVT5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KSR1Q8IVT5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KSR1Q8IVT5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KSR1Q8IVT5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KSR1Q8IVT5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KSR1Q8IVT5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KSR1Q8IVT5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KSR1Q8IVT5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
KSR1Q8IVT5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KSR1Q8IVT5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
KSR1Q8IVT5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
KSR1Q8IVT5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
KSR1Q8IVT5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms