Protein–RNA interactions for Protein: Q86UF4

CCDC190, Coiled-coil domain-containing protein 190, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC190Q86UF4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC190Q86UF4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC190Q86UF4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC190Q86UF4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC190Q86UF4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC190Q86UF4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC190Q86UF4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC190Q86UF4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC190Q86UF4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC190Q86UF4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC190Q86UF4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC190Q86UF4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC190Q86UF4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC190Q86UF4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC190Q86UF4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC190Q86UF4 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC190Q86UF4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC190Q86UF4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC190Q86UF4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC190Q86UF4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC190Q86UF4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC190Q86UF4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC190Q86UF4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC190Q86UF4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC190Q86UF4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC190Q86UF4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC190Q86UF4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC190Q86UF4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC190Q86UF4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC190Q86UF4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC190Q86UF4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC190Q86UF4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC190Q86UF4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC190Q86UF4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC190Q86UF4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC190Q86UF4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC190Q86UF4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
CCDC190Q86UF4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC190Q86UF4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC190Q86UF4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC190Q86UF4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC190Q86UF4 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC190Q86UF4 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC190Q86UF4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC190Q86UF4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC190Q86UF4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC190Q86UF4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC190Q86UF4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC190Q86UF4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC190Q86UF4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC190Q86UF4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC190Q86UF4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC190Q86UF4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC190Q86UF4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC190Q86UF4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC190Q86UF4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC190Q86UF4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC190Q86UF4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC190Q86UF4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC190Q86UF4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC190Q86UF4 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC190Q86UF4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC190Q86UF4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC190Q86UF4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC190Q86UF4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC190Q86UF4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC190Q86UF4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC190Q86UF4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC190Q86UF4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC190Q86UF4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC190Q86UF4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC190Q86UF4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC190Q86UF4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC190Q86UF4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC190Q86UF4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC190Q86UF4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC190Q86UF4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC190Q86UF4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC190Q86UF4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC190Q86UF4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC190Q86UF4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC190Q86UF4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC190Q86UF4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC190Q86UF4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC190Q86UF4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC190Q86UF4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC190Q86UF4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC190Q86UF4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC190Q86UF4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC190Q86UF4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC190Q86UF4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC190Q86UF4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC190Q86UF4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC190Q86UF4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC190Q86UF4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC190Q86UF4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC190Q86UF4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC190Q86UF4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC190Q86UF4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC190Q86UF4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms