Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNB6

NFXL1, NF-X1-type zinc finger protein NFXL1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFXL1Q6ZNB6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
NFXL1Q6ZNB6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NFXL1Q6ZNB6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NFXL1Q6ZNB6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NFXL1Q6ZNB6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NFXL1Q6ZNB6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NFXL1Q6ZNB6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NFXL1Q6ZNB6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NFXL1Q6ZNB6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NFXL1Q6ZNB6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NFXL1Q6ZNB6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
NFXL1Q6ZNB6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NFXL1Q6ZNB6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NFXL1Q6ZNB6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NFXL1Q6ZNB6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NFXL1Q6ZNB6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NFXL1Q6ZNB6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NFXL1Q6ZNB6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NFXL1Q6ZNB6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NFXL1Q6ZNB6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NFXL1Q6ZNB6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NFXL1Q6ZNB6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NFXL1Q6ZNB6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NFXL1Q6ZNB6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NFXL1Q6ZNB6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NFXL1Q6ZNB6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NFXL1Q6ZNB6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NFXL1Q6ZNB6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NFXL1Q6ZNB6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NFXL1Q6ZNB6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NFXL1Q6ZNB6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NFXL1Q6ZNB6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NFXL1Q6ZNB6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NFXL1Q6ZNB6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NFXL1Q6ZNB6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
NFXL1Q6ZNB6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
NFXL1Q6ZNB6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NFXL1Q6ZNB6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
NFXL1Q6ZNB6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NFXL1Q6ZNB6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NFXL1Q6ZNB6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NFXL1Q6ZNB6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NFXL1Q6ZNB6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NFXL1Q6ZNB6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NFXL1Q6ZNB6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NFXL1Q6ZNB6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
NFXL1Q6ZNB6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NFXL1Q6ZNB6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NFXL1Q6ZNB6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NFXL1Q6ZNB6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NFXL1Q6ZNB6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NFXL1Q6ZNB6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NFXL1Q6ZNB6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NFXL1Q6ZNB6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NFXL1Q6ZNB6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NFXL1Q6ZNB6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NFXL1Q6ZNB6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NFXL1Q6ZNB6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NFXL1Q6ZNB6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NFXL1Q6ZNB6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NFXL1Q6ZNB6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NFXL1Q6ZNB6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NFXL1Q6ZNB6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NFXL1Q6ZNB6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NFXL1Q6ZNB6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NFXL1Q6ZNB6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NFXL1Q6ZNB6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NFXL1Q6ZNB6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NFXL1Q6ZNB6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NFXL1Q6ZNB6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NFXL1Q6ZNB6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NFXL1Q6ZNB6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NFXL1Q6ZNB6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NFXL1Q6ZNB6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
NFXL1Q6ZNB6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NFXL1Q6ZNB6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NFXL1Q6ZNB6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
NFXL1Q6ZNB6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NFXL1Q6ZNB6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NFXL1Q6ZNB6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NFXL1Q6ZNB6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
NFXL1Q6ZNB6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NFXL1Q6ZNB6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NFXL1Q6ZNB6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NFXL1Q6ZNB6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NFXL1Q6ZNB6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NFXL1Q6ZNB6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NFXL1Q6ZNB6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
NFXL1Q6ZNB6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NFXL1Q6ZNB6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NFXL1Q6ZNB6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NFXL1Q6ZNB6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NFXL1Q6ZNB6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NFXL1Q6ZNB6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NFXL1Q6ZNB6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NFXL1Q6ZNB6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NFXL1Q6ZNB6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
NFXL1Q6ZNB6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NFXL1Q6ZNB6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NFXL1Q6ZNB6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.3 ms