Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB30

CSAG1, Putative chondrosarcoma-associated gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1Q6PB30 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CSAG1Q6PB30 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CSAG1Q6PB30 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CSAG1Q6PB30 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CSAG1Q6PB30 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CSAG1Q6PB30 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CSAG1Q6PB30 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CSAG1Q6PB30 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CSAG1Q6PB30 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CSAG1Q6PB30 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CSAG1Q6PB30 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CSAG1Q6PB30 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CSAG1Q6PB30 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CSAG1Q6PB30 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CSAG1Q6PB30 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CSAG1Q6PB30 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CSAG1Q6PB30 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
CSAG1Q6PB30 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
CSAG1Q6PB30 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
CSAG1Q6PB30 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
CSAG1Q6PB30 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CSAG1Q6PB30 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CSAG1Q6PB30 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
CSAG1Q6PB30 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
CSAG1Q6PB30 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
CSAG1Q6PB30 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CSAG1Q6PB30 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CSAG1Q6PB30 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
CSAG1Q6PB30 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CSAG1Q6PB30 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CSAG1Q6PB30 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CSAG1Q6PB30 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CSAG1Q6PB30 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CSAG1Q6PB30 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CSAG1Q6PB30 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CSAG1Q6PB30 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CSAG1Q6PB30 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CSAG1Q6PB30 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CSAG1Q6PB30 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
CSAG1Q6PB30 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CSAG1Q6PB30 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CSAG1Q6PB30 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CSAG1Q6PB30 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CSAG1Q6PB30 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CSAG1Q6PB30 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CSAG1Q6PB30 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CSAG1Q6PB30 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CSAG1Q6PB30 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CSAG1Q6PB30 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CSAG1Q6PB30 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CSAG1Q6PB30 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
CSAG1Q6PB30 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CSAG1Q6PB30 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CSAG1Q6PB30 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CSAG1Q6PB30 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CSAG1Q6PB30 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CSAG1Q6PB30 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CSAG1Q6PB30 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CSAG1Q6PB30 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CSAG1Q6PB30 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CSAG1Q6PB30 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CSAG1Q6PB30 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CSAG1Q6PB30 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CSAG1Q6PB30 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CSAG1Q6PB30 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CSAG1Q6PB30 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CSAG1Q6PB30 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CSAG1Q6PB30 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CSAG1Q6PB30 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CSAG1Q6PB30 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CSAG1Q6PB30 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CSAG1Q6PB30 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CSAG1Q6PB30 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CSAG1Q6PB30 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
CSAG1Q6PB30 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CSAG1Q6PB30 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CSAG1Q6PB30 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CSAG1Q6PB30 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
CSAG1Q6PB30 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CSAG1Q6PB30 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CSAG1Q6PB30 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CSAG1Q6PB30 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CSAG1Q6PB30 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CSAG1Q6PB30 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CSAG1Q6PB30 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CSAG1Q6PB30 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CSAG1Q6PB30 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CSAG1Q6PB30 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CSAG1Q6PB30 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CSAG1Q6PB30 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CSAG1Q6PB30 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CSAG1Q6PB30 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CSAG1Q6PB30 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CSAG1Q6PB30 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CSAG1Q6PB30 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
CSAG1Q6PB30 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
CSAG1Q6PB30 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CSAG1Q6PB30 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CSAG1Q6PB30 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CSAG1Q6PB30 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms