Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C9orf135Q5VTT2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C9orf135Q5VTT2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C9orf135Q5VTT2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C9orf135Q5VTT2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
C9orf135Q5VTT2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C9orf135Q5VTT2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C9orf135Q5VTT2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
C9orf135Q5VTT2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C9orf135Q5VTT2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C9orf135Q5VTT2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C9orf135Q5VTT2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C9orf135Q5VTT2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C9orf135Q5VTT2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C9orf135Q5VTT2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C9orf135Q5VTT2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C9orf135Q5VTT2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
C9orf135Q5VTT2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C9orf135Q5VTT2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C9orf135Q5VTT2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C9orf135Q5VTT2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C9orf135Q5VTT2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C9orf135Q5VTT2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
C9orf135Q5VTT2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
C9orf135Q5VTT2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C9orf135Q5VTT2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C9orf135Q5VTT2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
C9orf135Q5VTT2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
C9orf135Q5VTT2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
C9orf135Q5VTT2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
C9orf135Q5VTT2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
C9orf135Q5VTT2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
C9orf135Q5VTT2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
C9orf135Q5VTT2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
C9orf135Q5VTT2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
C9orf135Q5VTT2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
C9orf135Q5VTT2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
C9orf135Q5VTT2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
C9orf135Q5VTT2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
C9orf135Q5VTT2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C9orf135Q5VTT2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C9orf135Q5VTT2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
C9orf135Q5VTT2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C9orf135Q5VTT2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C9orf135Q5VTT2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C9orf135Q5VTT2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C9orf135Q5VTT2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
C9orf135Q5VTT2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C9orf135Q5VTT2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C9orf135Q5VTT2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C9orf135Q5VTT2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
C9orf135Q5VTT2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C9orf135Q5VTT2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C9orf135Q5VTT2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
C9orf135Q5VTT2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C9orf135Q5VTT2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C9orf135Q5VTT2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C9orf135Q5VTT2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
C9orf135Q5VTT2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
C9orf135Q5VTT2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C9orf135Q5VTT2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C9orf135Q5VTT2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
C9orf135Q5VTT2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C9orf135Q5VTT2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C9orf135Q5VTT2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C9orf135Q5VTT2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
C9orf135Q5VTT2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C9orf135Q5VTT2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C9orf135Q5VTT2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C9orf135Q5VTT2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C9orf135Q5VTT2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
C9orf135Q5VTT2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C9orf135Q5VTT2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C9orf135Q5VTT2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
C9orf135Q5VTT2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
C9orf135Q5VTT2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
C9orf135Q5VTT2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
C9orf135Q5VTT2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
C9orf135Q5VTT2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
C9orf135Q5VTT2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
C9orf135Q5VTT2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
C9orf135Q5VTT2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
C9orf135Q5VTT2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
C9orf135Q5VTT2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
C9orf135Q5VTT2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
C9orf135Q5VTT2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
C9orf135Q5VTT2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
C9orf135Q5VTT2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
C9orf135Q5VTT2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C9orf135Q5VTT2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C9orf135Q5VTT2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C9orf135Q5VTT2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C9orf135Q5VTT2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C9orf135Q5VTT2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C9orf135Q5VTT2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C9orf135Q5VTT2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C9orf135Q5VTT2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C9orf135Q5VTT2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C9orf135Q5VTT2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C9orf135Q5VTT2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms