Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTQ0

TTC39B, Tetratricopeptide repeat protein 39B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC39BQ5VTQ0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TTC39BQ5VTQ0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TTC39BQ5VTQ0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TTC39BQ5VTQ0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TTC39BQ5VTQ0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTC39BQ5VTQ0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTC39BQ5VTQ0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTC39BQ5VTQ0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTC39BQ5VTQ0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTC39BQ5VTQ0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTC39BQ5VTQ0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTC39BQ5VTQ0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTC39BQ5VTQ0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTC39BQ5VTQ0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTC39BQ5VTQ0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTC39BQ5VTQ0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTC39BQ5VTQ0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTC39BQ5VTQ0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TTC39BQ5VTQ0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTC39BQ5VTQ0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTC39BQ5VTQ0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TTC39BQ5VTQ0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTC39BQ5VTQ0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTC39BQ5VTQ0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTC39BQ5VTQ0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTC39BQ5VTQ0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTC39BQ5VTQ0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTC39BQ5VTQ0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTC39BQ5VTQ0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTC39BQ5VTQ0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TTC39BQ5VTQ0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTC39BQ5VTQ0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTC39BQ5VTQ0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TTC39BQ5VTQ0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTC39BQ5VTQ0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTC39BQ5VTQ0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTC39BQ5VTQ0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TTC39BQ5VTQ0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTC39BQ5VTQ0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTC39BQ5VTQ0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTC39BQ5VTQ0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTC39BQ5VTQ0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTC39BQ5VTQ0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTC39BQ5VTQ0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTC39BQ5VTQ0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTC39BQ5VTQ0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTC39BQ5VTQ0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTC39BQ5VTQ0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTC39BQ5VTQ0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TTC39BQ5VTQ0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TTC39BQ5VTQ0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTC39BQ5VTQ0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TTC39BQ5VTQ0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TTC39BQ5VTQ0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTC39BQ5VTQ0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTC39BQ5VTQ0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTC39BQ5VTQ0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TTC39BQ5VTQ0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTC39BQ5VTQ0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TTC39BQ5VTQ0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTC39BQ5VTQ0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTC39BQ5VTQ0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTC39BQ5VTQ0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTC39BQ5VTQ0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TTC39BQ5VTQ0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TTC39BQ5VTQ0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TTC39BQ5VTQ0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TTC39BQ5VTQ0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TTC39BQ5VTQ0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TTC39BQ5VTQ0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTC39BQ5VTQ0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTC39BQ5VTQ0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTC39BQ5VTQ0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTC39BQ5VTQ0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTC39BQ5VTQ0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTC39BQ5VTQ0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTC39BQ5VTQ0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TTC39BQ5VTQ0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTC39BQ5VTQ0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTC39BQ5VTQ0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTC39BQ5VTQ0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTC39BQ5VTQ0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTC39BQ5VTQ0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTC39BQ5VTQ0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTC39BQ5VTQ0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTC39BQ5VTQ0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTC39BQ5VTQ0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTC39BQ5VTQ0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTC39BQ5VTQ0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTC39BQ5VTQ0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTC39BQ5VTQ0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTC39BQ5VTQ0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTC39BQ5VTQ0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTC39BQ5VTQ0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTC39BQ5VTQ0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTC39BQ5VTQ0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTC39BQ5VTQ0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TTC39BQ5VTQ0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TTC39BQ5VTQ0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TTC39BQ5VTQ0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms