Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC93Q567U6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC93Q567U6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC93Q567U6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC93Q567U6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC93Q567U6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC93Q567U6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC93Q567U6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC93Q567U6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC93Q567U6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC93Q567U6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC93Q567U6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC93Q567U6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC93Q567U6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC93Q567U6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC93Q567U6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC93Q567U6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC93Q567U6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC93Q567U6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC93Q567U6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC93Q567U6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC93Q567U6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC93Q567U6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC93Q567U6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC93Q567U6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC93Q567U6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC93Q567U6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC93Q567U6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC93Q567U6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC93Q567U6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC93Q567U6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC93Q567U6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC93Q567U6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC93Q567U6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC93Q567U6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC93Q567U6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC93Q567U6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC93Q567U6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC93Q567U6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC93Q567U6 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC93Q567U6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC93Q567U6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC93Q567U6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC93Q567U6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC93Q567U6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC93Q567U6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC93Q567U6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC93Q567U6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC93Q567U6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC93Q567U6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC93Q567U6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC93Q567U6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC93Q567U6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC93Q567U6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC93Q567U6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC93Q567U6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC93Q567U6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC93Q567U6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC93Q567U6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC93Q567U6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC93Q567U6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC93Q567U6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC93Q567U6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC93Q567U6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC93Q567U6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC93Q567U6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC93Q567U6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
CCDC93Q567U6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC93Q567U6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC93Q567U6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC93Q567U6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC93Q567U6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC93Q567U6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC93Q567U6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC93Q567U6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC93Q567U6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC93Q567U6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC93Q567U6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC93Q567U6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC93Q567U6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC93Q567U6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC93Q567U6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC93Q567U6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC93Q567U6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC93Q567U6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC93Q567U6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC93Q567U6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC93Q567U6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC93Q567U6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CCDC93Q567U6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CCDC93Q567U6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CCDC93Q567U6 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CCDC93Q567U6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
CCDC93Q567U6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC93Q567U6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC93Q567U6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC93Q567U6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC93Q567U6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC93Q567U6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC93Q567U6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 471.9 ms