Protein–RNA interactions for Protein: Q53GD3

SLC44A4, Choline transporter-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC44A4Q53GD3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC44A4Q53GD3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC44A4Q53GD3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC44A4Q53GD3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC44A4Q53GD3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC44A4Q53GD3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC44A4Q53GD3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC44A4Q53GD3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC44A4Q53GD3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC44A4Q53GD3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC44A4Q53GD3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC44A4Q53GD3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC44A4Q53GD3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC44A4Q53GD3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC44A4Q53GD3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC44A4Q53GD3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC44A4Q53GD3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC44A4Q53GD3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC44A4Q53GD3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC44A4Q53GD3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC44A4Q53GD3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC44A4Q53GD3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC44A4Q53GD3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC44A4Q53GD3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC44A4Q53GD3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC44A4Q53GD3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC44A4Q53GD3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC44A4Q53GD3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC44A4Q53GD3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC44A4Q53GD3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC44A4Q53GD3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC44A4Q53GD3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC44A4Q53GD3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC44A4Q53GD3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC44A4Q53GD3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC44A4Q53GD3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC44A4Q53GD3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC44A4Q53GD3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC44A4Q53GD3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC44A4Q53GD3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC44A4Q53GD3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC44A4Q53GD3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC44A4Q53GD3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC44A4Q53GD3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC44A4Q53GD3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC44A4Q53GD3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC44A4Q53GD3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC44A4Q53GD3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC44A4Q53GD3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC44A4Q53GD3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC44A4Q53GD3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC44A4Q53GD3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC44A4Q53GD3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC44A4Q53GD3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC44A4Q53GD3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC44A4Q53GD3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC44A4Q53GD3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC44A4Q53GD3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC44A4Q53GD3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC44A4Q53GD3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC44A4Q53GD3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC44A4Q53GD3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC44A4Q53GD3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC44A4Q53GD3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC44A4Q53GD3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC44A4Q53GD3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC44A4Q53GD3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC44A4Q53GD3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC44A4Q53GD3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC44A4Q53GD3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC44A4Q53GD3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC44A4Q53GD3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC44A4Q53GD3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC44A4Q53GD3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC44A4Q53GD3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC44A4Q53GD3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC44A4Q53GD3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC44A4Q53GD3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC44A4Q53GD3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC44A4Q53GD3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC44A4Q53GD3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC44A4Q53GD3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC44A4Q53GD3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC44A4Q53GD3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC44A4Q53GD3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC44A4Q53GD3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC44A4Q53GD3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC44A4Q53GD3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC44A4Q53GD3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC44A4Q53GD3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC44A4Q53GD3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC44A4Q53GD3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC44A4Q53GD3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC44A4Q53GD3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC44A4Q53GD3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC44A4Q53GD3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC44A4Q53GD3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC44A4Q53GD3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC44A4Q53GD3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC44A4Q53GD3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms