Protein–RNA interactions for Protein: Q38SD2

LRRK1, Leucine-rich repeat serine/threonine-protein kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRK1Q38SD2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRK1Q38SD2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRK1Q38SD2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRK1Q38SD2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRK1Q38SD2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRRK1Q38SD2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRRK1Q38SD2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24■■□□□ 1.43
LRRK1Q38SD2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRRK1Q38SD2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRK1Q38SD2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRK1Q38SD2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRK1Q38SD2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRK1Q38SD2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRK1Q38SD2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRK1Q38SD2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRK1Q38SD2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRK1Q38SD2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRK1Q38SD2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRK1Q38SD2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRK1Q38SD2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRK1Q38SD2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRK1Q38SD2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRK1Q38SD2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRK1Q38SD2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRK1Q38SD2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRK1Q38SD2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRK1Q38SD2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRK1Q38SD2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRK1Q38SD2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRK1Q38SD2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRK1Q38SD2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRK1Q38SD2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRK1Q38SD2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRK1Q38SD2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRK1Q38SD2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRK1Q38SD2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRRK1Q38SD2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRRK1Q38SD2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRRK1Q38SD2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
LRRK1Q38SD2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRK1Q38SD2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRK1Q38SD2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRK1Q38SD2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRK1Q38SD2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRK1Q38SD2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRK1Q38SD2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRK1Q38SD2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRK1Q38SD2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRK1Q38SD2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRK1Q38SD2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRK1Q38SD2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRK1Q38SD2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRK1Q38SD2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRK1Q38SD2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRK1Q38SD2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRK1Q38SD2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRK1Q38SD2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRK1Q38SD2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRK1Q38SD2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRK1Q38SD2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRK1Q38SD2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRK1Q38SD2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRK1Q38SD2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRK1Q38SD2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRK1Q38SD2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRK1Q38SD2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRK1Q38SD2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRK1Q38SD2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LRRK1Q38SD2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LRRK1Q38SD2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LRRK1Q38SD2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LRRK1Q38SD2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LRRK1Q38SD2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRK1Q38SD2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRK1Q38SD2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRK1Q38SD2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRK1Q38SD2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRK1Q38SD2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRK1Q38SD2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRK1Q38SD2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRK1Q38SD2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRK1Q38SD2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRK1Q38SD2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRK1Q38SD2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRK1Q38SD2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRK1Q38SD2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRK1Q38SD2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRK1Q38SD2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRK1Q38SD2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRK1Q38SD2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRK1Q38SD2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRK1Q38SD2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRK1Q38SD2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRK1Q38SD2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRK1Q38SD2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRK1Q38SD2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRK1Q38SD2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRK1Q38SD2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRK1Q38SD2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRK1Q38SD2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 766.4 ms