Protein–RNA interactions for Protein: Q16864

ATP6V1F, V-type proton ATPase subunit F, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1FQ16864 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP6V1FQ16864 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP6V1FQ16864 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP6V1FQ16864 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP6V1FQ16864 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP6V1FQ16864 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP6V1FQ16864 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP6V1FQ16864 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP6V1FQ16864 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP6V1FQ16864 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATP6V1FQ16864 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATP6V1FQ16864 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATP6V1FQ16864 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATP6V1FQ16864 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATP6V1FQ16864 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATP6V1FQ16864 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATP6V1FQ16864 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP6V1FQ16864 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP6V1FQ16864 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP6V1FQ16864 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP6V1FQ16864 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP6V1FQ16864 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP6V1FQ16864 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP6V1FQ16864 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP6V1FQ16864 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP6V1FQ16864 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP6V1FQ16864 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP6V1FQ16864 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP6V1FQ16864 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP6V1FQ16864 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP6V1FQ16864 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP6V1FQ16864 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP6V1FQ16864 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP6V1FQ16864 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP6V1FQ16864 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP6V1FQ16864 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP6V1FQ16864 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP6V1FQ16864 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP6V1FQ16864 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP6V1FQ16864 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP6V1FQ16864 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP6V1FQ16864 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP6V1FQ16864 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP6V1FQ16864 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP6V1FQ16864 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP6V1FQ16864 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP6V1FQ16864 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP6V1FQ16864 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP6V1FQ16864 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP6V1FQ16864 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP6V1FQ16864 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP6V1FQ16864 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP6V1FQ16864 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP6V1FQ16864 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP6V1FQ16864 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP6V1FQ16864 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP6V1FQ16864 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP6V1FQ16864 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP6V1FQ16864 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP6V1FQ16864 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP6V1FQ16864 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP6V1FQ16864 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP6V1FQ16864 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP6V1FQ16864 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP6V1FQ16864 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP6V1FQ16864 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP6V1FQ16864 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP6V1FQ16864 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP6V1FQ16864 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP6V1FQ16864 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP6V1FQ16864 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP6V1FQ16864 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP6V1FQ16864 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP6V1FQ16864 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP6V1FQ16864 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP6V1FQ16864 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP6V1FQ16864 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP6V1FQ16864 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP6V1FQ16864 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP6V1FQ16864 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP6V1FQ16864 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ATP6V1FQ16864 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ATP6V1FQ16864 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ATP6V1FQ16864 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ATP6V1FQ16864 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ATP6V1FQ16864 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ATP6V1FQ16864 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP6V1FQ16864 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP6V1FQ16864 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP6V1FQ16864 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP6V1FQ16864 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP6V1FQ16864 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP6V1FQ16864 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP6V1FQ16864 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATP6V1FQ16864 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATP6V1FQ16864 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ATP6V1FQ16864 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATP6V1FQ16864 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
ATP6V1FQ16864 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ATP6V1FQ16864 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms