Protein–RNA interactions for Protein: Q15653

NFKBIB, NF-kappa-B inhibitor beta, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIBQ15653 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NFKBIBQ15653 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
NFKBIBQ15653 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NFKBIBQ15653 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NFKBIBQ15653 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NFKBIBQ15653 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
NFKBIBQ15653 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NFKBIBQ15653 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NFKBIBQ15653 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NFKBIBQ15653 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NFKBIBQ15653 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NFKBIBQ15653 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NFKBIBQ15653 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NFKBIBQ15653 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NFKBIBQ15653 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NFKBIBQ15653 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NFKBIBQ15653 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NFKBIBQ15653 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NFKBIBQ15653 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NFKBIBQ15653 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NFKBIBQ15653 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NFKBIBQ15653 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NFKBIBQ15653 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NFKBIBQ15653 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NFKBIBQ15653 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NFKBIBQ15653 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NFKBIBQ15653 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NFKBIBQ15653 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NFKBIBQ15653 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NFKBIBQ15653 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NFKBIBQ15653 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NFKBIBQ15653 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NFKBIBQ15653 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NFKBIBQ15653 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NFKBIBQ15653 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NFKBIBQ15653 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NFKBIBQ15653 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NFKBIBQ15653 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NFKBIBQ15653 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NFKBIBQ15653 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NFKBIBQ15653 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NFKBIBQ15653 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
NFKBIBQ15653 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NFKBIBQ15653 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
NFKBIBQ15653 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NFKBIBQ15653 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NFKBIBQ15653 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NFKBIBQ15653 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NFKBIBQ15653 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NFKBIBQ15653 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NFKBIBQ15653 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NFKBIBQ15653 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NFKBIBQ15653 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NFKBIBQ15653 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NFKBIBQ15653 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NFKBIBQ15653 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NFKBIBQ15653 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NFKBIBQ15653 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NFKBIBQ15653 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NFKBIBQ15653 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NFKBIBQ15653 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NFKBIBQ15653 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NFKBIBQ15653 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NFKBIBQ15653 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NFKBIBQ15653 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NFKBIBQ15653 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NFKBIBQ15653 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NFKBIBQ15653 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NFKBIBQ15653 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NFKBIBQ15653 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NFKBIBQ15653 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NFKBIBQ15653 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NFKBIBQ15653 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NFKBIBQ15653 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NFKBIBQ15653 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NFKBIBQ15653 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NFKBIBQ15653 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NFKBIBQ15653 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NFKBIBQ15653 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NFKBIBQ15653 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NFKBIBQ15653 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NFKBIBQ15653 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NFKBIBQ15653 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NFKBIBQ15653 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NFKBIBQ15653 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NFKBIBQ15653 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NFKBIBQ15653 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NFKBIBQ15653 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NFKBIBQ15653 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NFKBIBQ15653 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NFKBIBQ15653 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NFKBIBQ15653 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NFKBIBQ15653 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NFKBIBQ15653 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NFKBIBQ15653 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NFKBIBQ15653 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NFKBIBQ15653 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NFKBIBQ15653 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NFKBIBQ15653 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NFKBIBQ15653 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms