Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RYR3Q15413 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RYR3Q15413 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RYR3Q15413 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RYR3Q15413 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RYR3Q15413 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RYR3Q15413 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RYR3Q15413 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RYR3Q15413 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RYR3Q15413 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RYR3Q15413 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RYR3Q15413 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RYR3Q15413 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RYR3Q15413 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RYR3Q15413 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RYR3Q15413 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RYR3Q15413 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RYR3Q15413 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RYR3Q15413 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RYR3Q15413 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RYR3Q15413 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RYR3Q15413 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RYR3Q15413 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RYR3Q15413 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RYR3Q15413 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RYR3Q15413 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RYR3Q15413 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RYR3Q15413 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RYR3Q15413 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RYR3Q15413 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RYR3Q15413 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RYR3Q15413 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RYR3Q15413 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RYR3Q15413 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RYR3Q15413 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RYR3Q15413 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RYR3Q15413 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RYR3Q15413 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RYR3Q15413 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RYR3Q15413 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RYR3Q15413 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RYR3Q15413 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RYR3Q15413 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RYR3Q15413 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RYR3Q15413 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RYR3Q15413 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RYR3Q15413 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
RYR3Q15413 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RYR3Q15413 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RYR3Q15413 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RYR3Q15413 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RYR3Q15413 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RYR3Q15413 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RYR3Q15413 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RYR3Q15413 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RYR3Q15413 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RYR3Q15413 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RYR3Q15413 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RYR3Q15413 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RYR3Q15413 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RYR3Q15413 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RYR3Q15413 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RYR3Q15413 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RYR3Q15413 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RYR3Q15413 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RYR3Q15413 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RYR3Q15413 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RYR3Q15413 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RYR3Q15413 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RYR3Q15413 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RYR3Q15413 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RYR3Q15413 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RYR3Q15413 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RYR3Q15413 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RYR3Q15413 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RYR3Q15413 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RYR3Q15413 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RYR3Q15413 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RYR3Q15413 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RYR3Q15413 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RYR3Q15413 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RYR3Q15413 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RYR3Q15413 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RYR3Q15413 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RYR3Q15413 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RYR3Q15413 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RYR3Q15413 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RYR3Q15413 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RYR3Q15413 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RYR3Q15413 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RYR3Q15413 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RYR3Q15413 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RYR3Q15413 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RYR3Q15413 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RYR3Q15413 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RYR3Q15413 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RYR3Q15413 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RYR3Q15413 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RYR3Q15413 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RYR3Q15413 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
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