Protein–RNA interactions for Protein: Q15025

TNIP1, TNFAIP3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP1Q15025 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TNIP1Q15025 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TNIP1Q15025 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TNIP1Q15025 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TNIP1Q15025 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TNIP1Q15025 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TNIP1Q15025 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TNIP1Q15025 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
TNIP1Q15025 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TNIP1Q15025 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TNIP1Q15025 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TNIP1Q15025 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TNIP1Q15025 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TNIP1Q15025 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TNIP1Q15025 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TNIP1Q15025 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TNIP1Q15025 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TNIP1Q15025 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TNIP1Q15025 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TNIP1Q15025 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TNIP1Q15025 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TNIP1Q15025 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TNIP1Q15025 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TNIP1Q15025 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TNIP1Q15025 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TNIP1Q15025 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TNIP1Q15025 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TNIP1Q15025 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
TNIP1Q15025 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TNIP1Q15025 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TNIP1Q15025 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TNIP1Q15025 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TNIP1Q15025 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TNIP1Q15025 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TNIP1Q15025 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TNIP1Q15025 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TNIP1Q15025 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TNIP1Q15025 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TNIP1Q15025 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TNIP1Q15025 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TNIP1Q15025 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TNIP1Q15025 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TNIP1Q15025 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TNIP1Q15025 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TNIP1Q15025 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TNIP1Q15025 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TNIP1Q15025 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TNIP1Q15025 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TNIP1Q15025 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TNIP1Q15025 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TNIP1Q15025 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TNIP1Q15025 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
TNIP1Q15025 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TNIP1Q15025 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TNIP1Q15025 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TNIP1Q15025 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TNIP1Q15025 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TNIP1Q15025 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TNIP1Q15025 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TNIP1Q15025 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TNIP1Q15025 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TNIP1Q15025 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TNIP1Q15025 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TNIP1Q15025 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TNIP1Q15025 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
TNIP1Q15025 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TNIP1Q15025 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TNIP1Q15025 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TNIP1Q15025 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TNIP1Q15025 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TNIP1Q15025 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
TNIP1Q15025 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TNIP1Q15025 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TNIP1Q15025 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TNIP1Q15025 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TNIP1Q15025 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TNIP1Q15025 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TNIP1Q15025 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TNIP1Q15025 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TNIP1Q15025 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TNIP1Q15025 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TNIP1Q15025 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TNIP1Q15025 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TNIP1Q15025 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TNIP1Q15025 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TNIP1Q15025 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TNIP1Q15025 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TNIP1Q15025 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TNIP1Q15025 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TNIP1Q15025 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TNIP1Q15025 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TNIP1Q15025 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TNIP1Q15025 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
TNIP1Q15025 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
TNIP1Q15025 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TNIP1Q15025 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
TNIP1Q15025 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TNIP1Q15025 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TNIP1Q15025 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TNIP1Q15025 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.6 ms