Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SQLEQ14534 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SQLEQ14534 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SQLEQ14534 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SQLEQ14534 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SQLEQ14534 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SQLEQ14534 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SQLEQ14534 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SQLEQ14534 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SQLEQ14534 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SQLEQ14534 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SQLEQ14534 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SQLEQ14534 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SQLEQ14534 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SQLEQ14534 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SQLEQ14534 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SQLEQ14534 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SQLEQ14534 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SQLEQ14534 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
SQLEQ14534 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SQLEQ14534 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SQLEQ14534 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SQLEQ14534 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SQLEQ14534 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SQLEQ14534 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SQLEQ14534 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SQLEQ14534 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SQLEQ14534 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SQLEQ14534 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SQLEQ14534 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SQLEQ14534 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SQLEQ14534 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SQLEQ14534 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SQLEQ14534 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SQLEQ14534 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SQLEQ14534 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SQLEQ14534 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SQLEQ14534 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SQLEQ14534 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SQLEQ14534 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SQLEQ14534 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SQLEQ14534 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SQLEQ14534 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SQLEQ14534 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SQLEQ14534 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SQLEQ14534 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SQLEQ14534 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SQLEQ14534 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SQLEQ14534 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SQLEQ14534 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SQLEQ14534 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SQLEQ14534 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SQLEQ14534 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SQLEQ14534 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SQLEQ14534 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SQLEQ14534 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SQLEQ14534 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SQLEQ14534 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SQLEQ14534 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SQLEQ14534 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SQLEQ14534 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SQLEQ14534 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SQLEQ14534 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SQLEQ14534 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SQLEQ14534 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SQLEQ14534 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SQLEQ14534 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SQLEQ14534 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SQLEQ14534 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SQLEQ14534 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SQLEQ14534 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SQLEQ14534 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SQLEQ14534 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SQLEQ14534 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SQLEQ14534 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SQLEQ14534 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SQLEQ14534 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SQLEQ14534 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SQLEQ14534 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SQLEQ14534 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
SQLEQ14534 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SQLEQ14534 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SQLEQ14534 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SQLEQ14534 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SQLEQ14534 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SQLEQ14534 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SQLEQ14534 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SQLEQ14534 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SQLEQ14534 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SQLEQ14534 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SQLEQ14534 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SQLEQ14534 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SQLEQ14534 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SQLEQ14534 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SQLEQ14534 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SQLEQ14534 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SQLEQ14534 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SQLEQ14534 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SQLEQ14534 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SQLEQ14534 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms