Protein–RNA interactions for Protein: Q14151

SAFB2, Scaffold attachment factor B2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAFB2Q14151 KIAA0319L-215ENST00000478463 1489 ntTSL 232.83■■■□□ 2.852e-6■■■□□ 15.6
SAFB2Q14151 KIAA0319L-209ENST00000470388 872 ntTSL 525.86■■□□□ 1.732e-6■■■□□ 15.6
SAFB2Q14151 KIAA0319L-216ENST00000482929 1524 ntTSL 225.42■■□□□ 1.662e-6■■■□□ 15.6
SAFB2Q14151 KIAA0319L-219ENST00000492888 872 ntTSL 324.45■■□□□ 1.52e-6■■■□□ 15.6
SAFB2Q14151 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.022e-6■■■□□ 15.6
SAFB2Q14151 KIAA0319L-208ENST00000469892 889 ntTSL 517.97■□□□□ 0.472e-6■■■□□ 15.6
SAFB2Q14151 KIAA0319L-203ENST00000426982 3213 ntTSL 516.46■□□□□ 0.232e-6■■■□□ 15.6
SAFB2Q14151 KIAA0319L-220ENST00000494948 766 ntTSL 413.39□□□□□ -0.272e-6■■■□□ 15.6
SAFB2Q14151 KIAA0319L-205ENST00000440579 2171 ntTSL 212.5□□□□□ -0.412e-6■■■□□ 15.6
SAFB2Q14151 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.543e-6■■■□□ 15.6
SAFB2Q14151 ITFG1-204ENST00000544001 1849 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.433e-6■■■□□ 15.6
SAFB2Q14151 LINC01606-208ENST00000521653 557 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.483e-7■■■□□ 15.6
SAFB2Q14151 RBM41-201ENST00000372479 1662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.841e-6■■■□□ 15.6
SAFB2Q14151 RBM41-203ENST00000434854 680 ntTSL 55.82□□□□□ -1.481e-6■■■□□ 15.6
SAFB2Q14151 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.532e-6■■■□□ 15.6
SAFB2Q14151 GATA1-201ENST00000376665 1140 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.342e-6■■■□□ 15.6
SAFB2Q14151 MARCH3-201ENST00000308660 4196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.33e-6■■■□□ 15.5
SAFB2Q14151 UBE3A-222ENST00000630907 889 ntTSL 536.91■■■■□ 3.52e-6■■■□□ 15.5
SAFB2Q14151 UBE3A-213ENST00000626793 733 ntTSL 533.69■■■□□ 2.982e-6■■■□□ 15.5
SAFB2Q14151 UBE3A-218ENST00000629252 1112 ntTSL 530.23■■■□□ 2.432e-6■■■□□ 15.5
SAFB2Q14151 UBE3A-215ENST00000628267 779 ntTSL 529.72■■■□□ 2.352e-6■■■□□ 15.5
SAFB2Q14151 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.222e-6■■■□□ 15.5
SAFB2Q14151 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.552e-6■■■□□ 15.5
SAFB2Q14151 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.412e-6■■■□□ 15.5
SAFB2Q14151 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.392e-6■■■□□ 15.5
SAFB2Q14151 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.372e-6■■■□□ 15.5
SAFB2Q14151 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.342e-6■■■□□ 15.5
SAFB2Q14151 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.32e-6■■■□□ 15.5
SAFB2Q14151 UBE3A-226ENST00000637886 8725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.152e-6■■■□□ 15.5
SAFB2Q14151 UBE3A-228ENST00000638155 9131 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.122e-6■■■□□ 15.5
SAFB2Q14151 UBE3A-221ENST00000630607 1873 ntTSL 310.56□□□□□ -0.722e-6■■■□□ 15.5
SAFB2Q14151 UBE3A-205ENST00000566215 3176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.992e-6■■■□□ 15.5
SAFB2Q14151 UBE3A-219ENST00000629886 436 ntTSL 37.19□□□□□ -1.262e-6■■■□□ 15.5
SAFB2Q14151 UBE3A-203ENST00000428984 2986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.482e-6■■■□□ 15.5
SAFB2Q14151 UBE3A-217ENST00000628890 424 ntTSL 35.52□□□□□ -1.532e-6■■■□□ 15.5
SAFB2Q14151 UBE3A-210ENST00000626068 772 ntTSL 25.27□□□□□ -1.572e-6■■■□□ 15.5
SAFB2Q14151 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.62e-6■■■□□ 15.5
SAFB2Q14151 UBE3A-216ENST00000628733 706 ntTSL 54.14□□□□□ -1.752e-6■■■□□ 15.5
SAFB2Q14151 RUNX1-216ENST00000482318 1710 ntTSL 1 (best)29.93■■■□□ 2.383e-6■■■□□ 15.5
SAFB2Q14151 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.193e-6■■■□□ 15.5
SAFB2Q14151 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.963e-6■■■□□ 15.5
SAFB2Q14151 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.982e-6■■■□□ 15.5
SAFB2Q14151 AFAP1-AS1-201ENST00000608442 6795 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.542e-6■■■□□ 15.5
SAFB2Q14151 AC002480.1-201ENST00000442252 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.151e-6■■■□□ 15.4
SAFB2Q14151 AC134978.1-201ENST00000579480 788 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -01e-8■■■□□ 15.4
SAFB2Q14151 SETD2-203ENST00000412450 4231 ntTSL 215.28■□□□□ 0.042e-7■■■□□ 15.4
SAFB2Q14151 SETD2-201ENST00000330022 8172 ntTSL 1 (best)7.15□□□□□ -1.272e-7■■■□□ 15.4
SAFB2Q14151 SETD2-202ENST00000409792 8142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.282e-7■■■□□ 15.4
SAFB2Q14151 SETD2-204ENST00000431180 7555 ntTSL 26.83□□□□□ -1.322e-7■■■□□ 15.4
SAFB2Q14151 PTBP2-209ENST00000482253 2029 ntTSL 224.25■■□□□ 1.471e-6■■■□□ 15.4
SAFB2Q14151 PTBP2-205ENST00000460706 1129 ntTSL 217.15■□□□□ 0.341e-6■■■□□ 15.4
SAFB2Q14151 PTBP2-207ENST00000476419 1691 ntTSL 1 (best)12.28□□□□□ -0.441e-6■■■□□ 15.4
SAFB2Q14151 PTBP2-201ENST00000370197 3057 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.481e-6■■■□□ 15.4
SAFB2Q14151 PTBP2-202ENST00000370198 3054 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.481e-6■■■□□ 15.4
SAFB2Q14151 PTBP2-203ENST00000426398 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.761e-6■■■□□ 15.4
SAFB2Q14151 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.721e-6■■■□□ 15.4
SAFB2Q14151 ERV3-1-201ENST00000394323 2719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.642e-6■■■□□ 15.3
SAFB2Q14151 ZNF117-202ENST00000487644 1837 ntTSL 27.87□□□□□ -1.152e-6■■■□□ 15.3
SAFB2Q14151 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.792e-6■■■□□ 15.3
SAFB2Q14151 LINC01128-211ENST00000610067 550 ntTSL 425.02■■□□□ 1.62e-6■■■□□ 15.3
SAFB2Q14151 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.492e-6■■■□□ 15.3
SAFB2Q14151 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.472e-6■■■□□ 15.3
SAFB2Q14151 LINC01128-202ENST00000416570 612 ntTSL 323.17■■□□□ 1.32e-6■■■□□ 15.3
SAFB2Q14151 LINC01128-204ENST00000441765 750 ntTSL 221.97■■□□□ 1.112e-6■■■□□ 15.3
SAFB2Q14151 LINC01128-206ENST00000448975 633 ntTSL 519.64■□□□□ 0.732e-6■■■□□ 15.3
SAFB2Q14151 LINC01128-201ENST00000415295 894 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.312e-6■■■□□ 15.3
SAFB2Q14151 LINC01128-209ENST00000609009 767 ntTSL 515.94■□□□□ 0.142e-6■■■□□ 15.3
SAFB2Q14151 LINC01128-212ENST00000622921 724 ntTSL 515.06■□□□□ 02e-6■■■□□ 15.3
SAFB2Q14151 LINC01128-213ENST00000623070 494 ntTSL 415.06■□□□□ 02e-6■■■□□ 15.3
SAFB2Q14151 LINC01128-205ENST00000445118 6606 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.722e-6■■■□□ 15.3
SAFB2Q14151 LINC01128-214ENST00000623808 493 ntTSL 510.4□□□□□ -0.742e-6■■■□□ 15.3
SAFB2Q14151 LINC01128-215ENST00000624927 677 ntTSL 55.64□□□□□ -1.512e-6■■■□□ 15.3
SAFB2Q14151 ST6GAL1-214ENST00000455441 596 ntTSL 429.74■■■□□ 2.351e-7■■■□□ 15.3
SAFB2Q14151 ST6GAL1-205ENST00000427315 544 ntTSL 429.45■■■□□ 2.311e-7■■■□□ 15.3
SAFB2Q14151 ST6GAL1-216ENST00000458216 507 ntTSL 318.15■□□□□ 0.51e-7■■■□□ 15.3
SAFB2Q14151 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.421e-7■■■□□ 15.3
SAFB2Q14151 ST6GAL1-207ENST00000438590 608 ntTSL 317.09■□□□□ 0.331e-7■■■□□ 15.3
SAFB2Q14151 ST6GAL1-215ENST00000457772 3947 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.221e-7■■■□□ 15.3
SAFB2Q14151 ST6GAL1-212ENST00000448408 1005 ntTSL 514.38□□□□□ -0.111e-7■■■□□ 15.3
SAFB2Q14151 ST6GAL1-206ENST00000430309 504 ntTSL 412.02□□□□□ -0.491e-7■■■□□ 15.3
SAFB2Q14151 ST6GAL1-203ENST00000417392 707 ntTSL 211.64□□□□□ -0.551e-7■■■□□ 15.3
SAFB2Q14151 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.417e-7■■■□□ 15.3
SAFB2Q14151 ZNF131-205ENST00000504359 565 ntTSL 423.61■■□□□ 1.377e-7■■■□□ 15.3
SAFB2Q14151 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.97e-7■■■□□ 15.3
SAFB2Q14151 ZNF131-218ENST00000511736 956 ntTSL 1 (best)20.21■□□□□ 0.837e-7■■■□□ 15.3
SAFB2Q14151 ZNF131-220ENST00000515326 1050 ntTSL 1 (best)17.53■□□□□ 0.47e-7■■■□□ 15.3
SAFB2Q14151 ZNF131-212ENST00000509156 2063 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.17e-7■■■□□ 15.3
SAFB2Q14151 ZNF131-213ENST00000509341 572 ntTSL 514.85□□□□□ -0.037e-7■■■□□ 15.3
SAFB2Q14151 ZNF131-216ENST00000510026 2599 ntTSL 514.61□□□□□ -0.077e-7■■■□□ 15.3
SAFB2Q14151 ZNF131-207ENST00000507218 1352 ntTSL 1 (best)11.66□□□□□ -0.547e-7■■■□□ 15.3
SAFB2Q14151 ZNF131-201ENST00000306938 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.887e-7■■■□□ 15.3
SAFB2Q14151 ZNF131-215ENST00000509931 970 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.37e-7■■■□□ 15.3
SAFB2Q14151 ZNF131-210ENST00000508259 501 ntTSL 53.25□□□□□ -1.897e-7■■■□□ 15.3
SAFB2Q14151 XRCC2-202ENST00000495707 4728 ntTSL 1 (best)12.05□□□□□ -0.483e-7■■■□□ 15.3
SAFB2Q14151 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.178e-7■■■□□ 15.3
SAFB2Q14151 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.258e-7■■■□□ 15.3
SAFB2Q14151 FAM178B-205ENST00000494172 592 ntTSL 325.85■■□□□ 1.736e-8■■■□□ 15.2
SAFB2Q14151 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.336e-8■■■□□ 15.2
SAFB2Q14151 FAM178B-201ENST00000393526 1004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.576e-8■■■□□ 15.2
SAFB2Q14151 FAM178B-202ENST00000470789 722 ntTSL 1 (best)16.36■□□□□ 0.216e-8■■■□□ 15.2
Retrieved 100 of 3,296 protein–RNA pairs in 87.9 ms