RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000630907.2

UBE3A-222, Transcript of ubiquitin protein ligase E3A, human

TSL 5

Gene UBE3A, Length 889 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBE3A-222	ENST00000630907	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		62.07	■■■■■ 7.53
UBE3A-222	ENST00000630907	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		54.87	■■■■■ 6.37
UBE3A-222	ENST00000630907	ABCC9	O60706	1549 aa		53.22	■■■■■ 6.11
UBE3A-222	ENST00000630907	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	51.8	■■■■■ 5.88
UBE3A-222	ENST00000630907	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		51.73	■■■■■ 5.87
UBE3A-222	ENST00000630907	NACAD	O15069	1562 aa		51.49	■■■■■ 5.83
UBE3A-222	ENST00000630907	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		51.41	■■■■■ 5.82
UBE3A-222	ENST00000630907	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		51.37	■■■■■ 5.81
UBE3A-222	ENST00000630907	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		51.36	■■■■■ 5.81
UBE3A-222	ENST00000630907	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		50.17	■■■■■ 5.62
UBE3A-222	ENST00000630907	SCRIB	Q14160	1630 aa		50.15	■■■■■ 5.62
UBE3A-222	ENST00000630907	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	49.88	■■■■■ 5.58
UBE3A-222	ENST00000630907	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		49.82	■■■■■ 5.57
UBE3A-222	ENST00000630907	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		49.42	■■■■■ 5.5
UBE3A-222	ENST00000630907	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	48.47	■■■■■ 5.35
UBE3A-222	ENST00000630907	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		48.36	■■■■■ 5.33
UBE3A-222	ENST00000630907	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		48.3	■■■■■ 5.32
UBE3A-222	ENST00000630907	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		48.13	■■■■■ 5.3
UBE3A-222	ENST00000630907	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	48.06	■■■■■ 5.28
UBE3A-222	ENST00000630907	SMARCA4	P51532	1647 aa		48.01	■■■■■ 5.28
UBE3A-222	ENST00000630907	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		47.84	■■■■■ 5.25
UBE3A-222	ENST00000630907	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		47.65	■■■■■ 5.22
UBE3A-222	ENST00000630907	SMARCA2	P51531	1590 aa		47.6	■■■■■ 5.21
UBE3A-222	ENST00000630907	NCAPD3	P42695	1498 aa		47.53	■■■■■ 5.2
UBE3A-222	ENST00000630907	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		47.53	■■■■■ 5.2
UBE3A-222	ENST00000630907	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	47.52	■■■■■ 5.2
UBE3A-222	ENST00000630907	WIZ	O95785	1651 aa		47.34	■■■■■ 5.17
UBE3A-222	ENST00000630907	HMGXB3	Q12766	1538 aa		47.31	■■■■■ 5.16
UBE3A-222	ENST00000630907	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	47.28	■■■■■ 5.16
UBE3A-222	ENST00000630907	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	46.88	■■■■■ 5.09
UBE3A-222	ENST00000630907	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	46.82	■■■■■ 5.09
UBE3A-222	ENST00000630907	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		46.36	■■■■■ 5.01
UBE3A-222	ENST00000630907	NES	P48681	1621 aa		46.21	■■■■■ 4.99
UBE3A-222	ENST00000630907	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		46.21	■■■■■ 4.99
UBE3A-222	ENST00000630907	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		46.16	■■■■■ 4.98
UBE3A-222	ENST00000630907	CFTR	P13569	1480 aa		46.02	■■■■■ 4.96
UBE3A-222	ENST00000630907	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		45.88	■■■■■ 4.94
UBE3A-222	ENST00000630907	ERCC6	Q03468	1493 aa		45.84	■■■■■ 4.93
UBE3A-222	ENST00000630907	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		45.65	■■■■■ 4.9
UBE3A-222	ENST00000630907	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		45.63	■■■■■ 4.89
UBE3A-222	ENST00000630907	PRDM2	Q13029	1718 aa		45.62	■■■■■ 4.89
UBE3A-222	ENST00000630907	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		45.54	■■■■■ 4.88
UBE3A-222	ENST00000630907	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		45.36	■■■■■ 4.85
UBE3A-222	ENST00000630907	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	45.34	■■■■■ 4.85
UBE3A-222	ENST00000630907	WDR62	O43379	1518 aa		45.16	■■■■■ 4.82
UBE3A-222	ENST00000630907	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	45.15	■■■■■ 4.82
UBE3A-222	ENST00000630907	CUX2	O14529	1486 aa		45.12	■■■■■ 4.81
UBE3A-222	ENST00000630907	ABCC8	Q09428	1581 aa		45.02	■■■■■ 4.8
UBE3A-222	ENST00000630907	TOPBP1	Q92547	1522 aa		44.98	■■■■■ 4.79
UBE3A-222	ENST00000630907	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		44.96	■■■■■ 4.79
UBE3A-222	ENST00000630907	CUX1	P39880	1505 aa		44.84	■■■■■ 4.77
UBE3A-222	ENST00000630907	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	44.8	■■■■■ 4.76	5e-6	■■■■■ 29.2
UBE3A-222	ENST00000630907	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	44.64	■■■■■ 4.74
UBE3A-222	ENST00000630907	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		44.62	■■■■■ 4.73
UBE3A-222	ENST00000630907	SYNJ1	O43426	1573 aa		44.61	■■■■■ 4.73
UBE3A-222	ENST00000630907	TOP2B	Q02880	1626 aa		44.6	■■■■■ 4.73
UBE3A-222	ENST00000630907	IFT140	Q96RY7	1462 aa		44.57	■■■■■ 4.73
UBE3A-222	ENST00000630907	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		44.57	■■■■■ 4.72
UBE3A-222	ENST00000630907	SOGA1	O94964	1423 aa		44.5	■■■■■ 4.71
UBE3A-222	ENST00000630907	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		44.46	■■■■■ 4.71
UBE3A-222	ENST00000630907	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	44.41	■■■■■ 4.7
UBE3A-222	ENST00000630907	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	44.31	■■■■■ 4.68
UBE3A-222	ENST00000630907	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		44.21	■■■■■ 4.67
UBE3A-222	ENST00000630907	TRIM41	Q8WV44	630 aa		44.19	■■■■■ 4.66
UBE3A-222	ENST00000630907	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	44.18	■■■■■ 4.66
UBE3A-222	ENST00000630907	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	44.16	■■■■■ 4.66	3e-6	■■■■□ 22.1
UBE3A-222	ENST00000630907	WDR97	A6NE52	1622 aa		44.14	■■■■■ 4.66
UBE3A-222	ENST00000630907	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	44.12	■■■■■ 4.65
UBE3A-222	ENST00000630907	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		44.01	■■■■■ 4.64
UBE3A-222	ENST00000630907	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		43.97	■■■■■ 4.63
UBE3A-222	ENST00000630907	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		43.94	■■■■■ 4.62
UBE3A-222	ENST00000630907	GRIN2B	Q13224	1484 aa		43.89	■■■■■ 4.62
UBE3A-222	ENST00000630907	KIF27	Q86VH2	1401 aa		43.83	■■■■■ 4.61
UBE3A-222	ENST00000630907	PBRM1	Q86U86	1689 aa		43.77	■■■■■ 4.6
UBE3A-222	ENST00000630907	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		43.75	■■■■■ 4.59
UBE3A-222	ENST00000630907	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	43.7	■■■■■ 4.59
UBE3A-222	ENST00000630907	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		43.68	■■■■■ 4.58
UBE3A-222	ENST00000630907	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		43.59	■■■■■ 4.57
UBE3A-222	ENST00000630907	IGF1R	P08069	1367 aa		43.59	■■■■■ 4.57
UBE3A-222	ENST00000630907	FBLN2	P98095	1184 aa		43.57	■■■■■ 4.57
UBE3A-222	ENST00000630907	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	43.54	■■■■■ 4.56
UBE3A-222	ENST00000630907	SYNJ2	O15056	1496 aa		43.53	■■■■■ 4.56
UBE3A-222	ENST00000630907	ADAMTS12	P58397	1594 aa		43.5	■■■■■ 4.55
UBE3A-222	ENST00000630907	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		43.49	■■■■■ 4.55
UBE3A-222	ENST00000630907	CHD1	O14646	1710 aa		43.44	■■■■■ 4.54
UBE3A-222	ENST00000630907	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		43.43	■■■■■ 4.54
UBE3A-222	ENST00000630907	CUL7	Q14999	1698 aa		43.37	■■■■■ 4.53
UBE3A-222	ENST00000630907	EEA1	Q15075	1411 aa		43.37	■■■■■ 4.53
UBE3A-222	ENST00000630907	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		43.35	■■■■■ 4.53
UBE3A-222	ENST00000630907	GRIN2A	Q12879	1464 aa		43.32	■■■■■ 4.52
UBE3A-222	ENST00000630907	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	43.27	■■■■■ 4.52
UBE3A-222	ENST00000630907	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		43.27	■■■■■ 4.52
UBE3A-222	ENST00000630907	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		43.13	■■■■■ 4.5
UBE3A-222	ENST00000630907	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		43.13	■■■■■ 4.49
UBE3A-222	ENST00000630907	PRX	Q9BXM0	1461 aa		43.11	■■■■■ 4.49
UBE3A-222	ENST00000630907	NUP160	Q12769	1436 aa		43.1	■■■■■ 4.49
UBE3A-222	ENST00000630907	CEP170	Q5SW79	1584 aa		43.06	■■■■■ 4.48
UBE3A-222	ENST00000630907	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		43.01	■■■■■ 4.48
UBE3A-222	ENST00000630907	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		42.85	■■■■■ 4.45
UBE3A-222	ENST00000630907	KIF21B	O75037	1637 aa		42.82	■■■■■ 4.45

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