Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CUL3Q13618 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CUL3Q13618 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CUL3Q13618 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CUL3Q13618 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CUL3Q13618 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CUL3Q13618 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CUL3Q13618 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CUL3Q13618 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CUL3Q13618 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CUL3Q13618 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CUL3Q13618 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CUL3Q13618 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CUL3Q13618 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CUL3Q13618 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CUL3Q13618 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CUL3Q13618 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CUL3Q13618 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CUL3Q13618 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CUL3Q13618 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CUL3Q13618 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CUL3Q13618 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CUL3Q13618 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CUL3Q13618 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CUL3Q13618 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CUL3Q13618 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CUL3Q13618 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CUL3Q13618 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CUL3Q13618 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CUL3Q13618 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CUL3Q13618 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CUL3Q13618 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CUL3Q13618 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CUL3Q13618 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CUL3Q13618 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CUL3Q13618 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CUL3Q13618 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CUL3Q13618 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CUL3Q13618 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CUL3Q13618 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CUL3Q13618 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CUL3Q13618 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CUL3Q13618 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CUL3Q13618 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CUL3Q13618 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CUL3Q13618 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CUL3Q13618 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CUL3Q13618 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CUL3Q13618 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CUL3Q13618 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CUL3Q13618 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CUL3Q13618 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CUL3Q13618 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CUL3Q13618 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CUL3Q13618 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CUL3Q13618 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CUL3Q13618 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CUL3Q13618 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CUL3Q13618 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CUL3Q13618 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CUL3Q13618 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CUL3Q13618 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CUL3Q13618 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CUL3Q13618 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CUL3Q13618 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CUL3Q13618 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CUL3Q13618 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CUL3Q13618 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CUL3Q13618 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CUL3Q13618 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CUL3Q13618 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CUL3Q13618 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CUL3Q13618 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CUL3Q13618 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CUL3Q13618 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CUL3Q13618 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CUL3Q13618 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CUL3Q13618 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CUL3Q13618 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CUL3Q13618 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CUL3Q13618 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CUL3Q13618 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CUL3Q13618 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CUL3Q13618 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CUL3Q13618 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CUL3Q13618 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CUL3Q13618 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CUL3Q13618 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CUL3Q13618 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CUL3Q13618 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CUL3Q13618 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CUL3Q13618 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CUL3Q13618 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CUL3Q13618 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CUL3Q13618 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CUL3Q13618 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CUL3Q13618 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CUL3Q13618 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CUL3Q13618 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CUL3Q13618 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
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