Protein–RNA interactions for Protein: Q12888

TP53BP1, TP53-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,972 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP53BP1Q12888 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TP53BP1Q12888 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TP53BP1Q12888 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TP53BP1Q12888 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TP53BP1Q12888 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TP53BP1Q12888 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TP53BP1Q12888 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TP53BP1Q12888 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TP53BP1Q12888 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TP53BP1Q12888 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TP53BP1Q12888 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TP53BP1Q12888 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TP53BP1Q12888 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TP53BP1Q12888 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TP53BP1Q12888 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TP53BP1Q12888 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TP53BP1Q12888 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TP53BP1Q12888 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TP53BP1Q12888 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TP53BP1Q12888 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TP53BP1Q12888 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TP53BP1Q12888 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TP53BP1Q12888 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TP53BP1Q12888 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TP53BP1Q12888 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TP53BP1Q12888 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TP53BP1Q12888 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TP53BP1Q12888 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TP53BP1Q12888 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TP53BP1Q12888 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TP53BP1Q12888 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TP53BP1Q12888 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TP53BP1Q12888 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TP53BP1Q12888 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TP53BP1Q12888 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TP53BP1Q12888 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TP53BP1Q12888 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TP53BP1Q12888 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TP53BP1Q12888 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TP53BP1Q12888 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TP53BP1Q12888 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TP53BP1Q12888 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TP53BP1Q12888 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TP53BP1Q12888 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TP53BP1Q12888 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TP53BP1Q12888 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TP53BP1Q12888 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TP53BP1Q12888 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TP53BP1Q12888 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TP53BP1Q12888 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TP53BP1Q12888 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TP53BP1Q12888 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TP53BP1Q12888 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TP53BP1Q12888 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TP53BP1Q12888 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TP53BP1Q12888 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TP53BP1Q12888 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TP53BP1Q12888 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TP53BP1Q12888 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TP53BP1Q12888 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TP53BP1Q12888 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TP53BP1Q12888 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TP53BP1Q12888 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TP53BP1Q12888 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TP53BP1Q12888 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TP53BP1Q12888 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TP53BP1Q12888 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TP53BP1Q12888 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TP53BP1Q12888 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TP53BP1Q12888 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TP53BP1Q12888 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TP53BP1Q12888 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TP53BP1Q12888 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TP53BP1Q12888 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TP53BP1Q12888 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TP53BP1Q12888 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TP53BP1Q12888 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TP53BP1Q12888 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TP53BP1Q12888 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TP53BP1Q12888 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TP53BP1Q12888 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TP53BP1Q12888 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TP53BP1Q12888 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TP53BP1Q12888 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TP53BP1Q12888 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TP53BP1Q12888 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TP53BP1Q12888 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TP53BP1Q12888 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TP53BP1Q12888 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TP53BP1Q12888 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TP53BP1Q12888 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TP53BP1Q12888 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TP53BP1Q12888 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TP53BP1Q12888 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TP53BP1Q12888 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TP53BP1Q12888 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TP53BP1Q12888 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TP53BP1Q12888 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TP53BP1Q12888 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TP53BP1Q12888 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms