Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGL1

LAMTOR4, Ragulator complex protein LAMTOR4, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMTOR4Q0VGL1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LAMTOR4Q0VGL1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LAMTOR4Q0VGL1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LAMTOR4Q0VGL1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LAMTOR4Q0VGL1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LAMTOR4Q0VGL1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LAMTOR4Q0VGL1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LAMTOR4Q0VGL1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
LAMTOR4Q0VGL1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LAMTOR4Q0VGL1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LAMTOR4Q0VGL1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LAMTOR4Q0VGL1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LAMTOR4Q0VGL1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LAMTOR4Q0VGL1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
LAMTOR4Q0VGL1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LAMTOR4Q0VGL1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LAMTOR4Q0VGL1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LAMTOR4Q0VGL1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LAMTOR4Q0VGL1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LAMTOR4Q0VGL1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LAMTOR4Q0VGL1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LAMTOR4Q0VGL1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LAMTOR4Q0VGL1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LAMTOR4Q0VGL1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
LAMTOR4Q0VGL1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LAMTOR4Q0VGL1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LAMTOR4Q0VGL1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LAMTOR4Q0VGL1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LAMTOR4Q0VGL1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LAMTOR4Q0VGL1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LAMTOR4Q0VGL1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LAMTOR4Q0VGL1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LAMTOR4Q0VGL1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LAMTOR4Q0VGL1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LAMTOR4Q0VGL1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LAMTOR4Q0VGL1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LAMTOR4Q0VGL1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LAMTOR4Q0VGL1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LAMTOR4Q0VGL1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LAMTOR4Q0VGL1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LAMTOR4Q0VGL1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LAMTOR4Q0VGL1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
LAMTOR4Q0VGL1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
LAMTOR4Q0VGL1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LAMTOR4Q0VGL1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LAMTOR4Q0VGL1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LAMTOR4Q0VGL1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LAMTOR4Q0VGL1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LAMTOR4Q0VGL1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LAMTOR4Q0VGL1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LAMTOR4Q0VGL1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LAMTOR4Q0VGL1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LAMTOR4Q0VGL1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LAMTOR4Q0VGL1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LAMTOR4Q0VGL1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LAMTOR4Q0VGL1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LAMTOR4Q0VGL1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LAMTOR4Q0VGL1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LAMTOR4Q0VGL1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LAMTOR4Q0VGL1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LAMTOR4Q0VGL1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
LAMTOR4Q0VGL1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
LAMTOR4Q0VGL1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LAMTOR4Q0VGL1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LAMTOR4Q0VGL1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LAMTOR4Q0VGL1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LAMTOR4Q0VGL1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LAMTOR4Q0VGL1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LAMTOR4Q0VGL1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LAMTOR4Q0VGL1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LAMTOR4Q0VGL1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LAMTOR4Q0VGL1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LAMTOR4Q0VGL1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LAMTOR4Q0VGL1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LAMTOR4Q0VGL1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LAMTOR4Q0VGL1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LAMTOR4Q0VGL1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LAMTOR4Q0VGL1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LAMTOR4Q0VGL1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LAMTOR4Q0VGL1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LAMTOR4Q0VGL1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LAMTOR4Q0VGL1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LAMTOR4Q0VGL1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LAMTOR4Q0VGL1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LAMTOR4Q0VGL1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LAMTOR4Q0VGL1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LAMTOR4Q0VGL1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LAMTOR4Q0VGL1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LAMTOR4Q0VGL1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LAMTOR4Q0VGL1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LAMTOR4Q0VGL1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LAMTOR4Q0VGL1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LAMTOR4Q0VGL1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LAMTOR4Q0VGL1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LAMTOR4Q0VGL1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
LAMTOR4Q0VGL1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
LAMTOR4Q0VGL1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
LAMTOR4Q0VGL1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LAMTOR4Q0VGL1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
LAMTOR4Q0VGL1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms