Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CYP4F3Q08477 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CYP4F3Q08477 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CYP4F3Q08477 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CYP4F3Q08477 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CYP4F3Q08477 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CYP4F3Q08477 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CYP4F3Q08477 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CYP4F3Q08477 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CYP4F3Q08477 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CYP4F3Q08477 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CYP4F3Q08477 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CYP4F3Q08477 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CYP4F3Q08477 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CYP4F3Q08477 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CYP4F3Q08477 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CYP4F3Q08477 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CYP4F3Q08477 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CYP4F3Q08477 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CYP4F3Q08477 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CYP4F3Q08477 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CYP4F3Q08477 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CYP4F3Q08477 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CYP4F3Q08477 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CYP4F3Q08477 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CYP4F3Q08477 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CYP4F3Q08477 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CYP4F3Q08477 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CYP4F3Q08477 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CYP4F3Q08477 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CYP4F3Q08477 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CYP4F3Q08477 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CYP4F3Q08477 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CYP4F3Q08477 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CYP4F3Q08477 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CYP4F3Q08477 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CYP4F3Q08477 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CYP4F3Q08477 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CYP4F3Q08477 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CYP4F3Q08477 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CYP4F3Q08477 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CYP4F3Q08477 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CYP4F3Q08477 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CYP4F3Q08477 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CYP4F3Q08477 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CYP4F3Q08477 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CYP4F3Q08477 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CYP4F3Q08477 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CYP4F3Q08477 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CYP4F3Q08477 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CYP4F3Q08477 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CYP4F3Q08477 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CYP4F3Q08477 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CYP4F3Q08477 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CYP4F3Q08477 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CYP4F3Q08477 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CYP4F3Q08477 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CYP4F3Q08477 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CYP4F3Q08477 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CYP4F3Q08477 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CYP4F3Q08477 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CYP4F3Q08477 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYP4F3Q08477 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYP4F3Q08477 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYP4F3Q08477 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYP4F3Q08477 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CYP4F3Q08477 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYP4F3Q08477 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYP4F3Q08477 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYP4F3Q08477 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYP4F3Q08477 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYP4F3Q08477 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYP4F3Q08477 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYP4F3Q08477 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CYP4F3Q08477 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CYP4F3Q08477 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CYP4F3Q08477 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CYP4F3Q08477 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CYP4F3Q08477 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CYP4F3Q08477 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CYP4F3Q08477 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYP4F3Q08477 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYP4F3Q08477 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYP4F3Q08477 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CYP4F3Q08477 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYP4F3Q08477 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYP4F3Q08477 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYP4F3Q08477 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CYP4F3Q08477 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CYP4F3Q08477 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CYP4F3Q08477 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CYP4F3Q08477 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CYP4F3Q08477 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CYP4F3Q08477 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CYP4F3Q08477 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CYP4F3Q08477 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYP4F3Q08477 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYP4F3Q08477 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CYP4F3Q08477 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYP4F3Q08477 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms