Protein–RNA interactions for Protein: Q06455

RUNX1T1, Protein CBFA2T1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1T1Q06455 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RUNX1T1Q06455 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RUNX1T1Q06455 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RUNX1T1Q06455 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RUNX1T1Q06455 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RUNX1T1Q06455 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RUNX1T1Q06455 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RUNX1T1Q06455 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RUNX1T1Q06455 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RUNX1T1Q06455 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RUNX1T1Q06455 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RUNX1T1Q06455 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RUNX1T1Q06455 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RUNX1T1Q06455 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RUNX1T1Q06455 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RUNX1T1Q06455 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RUNX1T1Q06455 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RUNX1T1Q06455 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RUNX1T1Q06455 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RUNX1T1Q06455 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RUNX1T1Q06455 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RUNX1T1Q06455 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RUNX1T1Q06455 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RUNX1T1Q06455 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RUNX1T1Q06455 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RUNX1T1Q06455 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RUNX1T1Q06455 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RUNX1T1Q06455 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RUNX1T1Q06455 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RUNX1T1Q06455 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RUNX1T1Q06455 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RUNX1T1Q06455 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RUNX1T1Q06455 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RUNX1T1Q06455 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RUNX1T1Q06455 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RUNX1T1Q06455 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RUNX1T1Q06455 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RUNX1T1Q06455 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RUNX1T1Q06455 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RUNX1T1Q06455 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RUNX1T1Q06455 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RUNX1T1Q06455 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUNX1T1Q06455 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUNX1T1Q06455 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUNX1T1Q06455 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUNX1T1Q06455 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUNX1T1Q06455 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUNX1T1Q06455 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUNX1T1Q06455 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RUNX1T1Q06455 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RUNX1T1Q06455 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RUNX1T1Q06455 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RUNX1T1Q06455 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RUNX1T1Q06455 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RUNX1T1Q06455 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RUNX1T1Q06455 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RUNX1T1Q06455 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RUNX1T1Q06455 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RUNX1T1Q06455 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RUNX1T1Q06455 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RUNX1T1Q06455 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RUNX1T1Q06455 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RUNX1T1Q06455 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RUNX1T1Q06455 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RUNX1T1Q06455 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RUNX1T1Q06455 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RUNX1T1Q06455 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RUNX1T1Q06455 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RUNX1T1Q06455 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RUNX1T1Q06455 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RUNX1T1Q06455 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RUNX1T1Q06455 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RUNX1T1Q06455 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RUNX1T1Q06455 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RUNX1T1Q06455 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RUNX1T1Q06455 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RUNX1T1Q06455 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RUNX1T1Q06455 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RUNX1T1Q06455 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RUNX1T1Q06455 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RUNX1T1Q06455 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RUNX1T1Q06455 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RUNX1T1Q06455 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RUNX1T1Q06455 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RUNX1T1Q06455 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RUNX1T1Q06455 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RUNX1T1Q06455 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RUNX1T1Q06455 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RUNX1T1Q06455 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RUNX1T1Q06455 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RUNX1T1Q06455 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RUNX1T1Q06455 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RUNX1T1Q06455 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RUNX1T1Q06455 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RUNX1T1Q06455 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RUNX1T1Q06455 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RUNX1T1Q06455 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RUNX1T1Q06455 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RUNX1T1Q06455 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RUNX1T1Q06455 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms