Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
EXOSC9Q06265 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
EXOSC9Q06265 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
EXOSC9Q06265 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
EXOSC9Q06265 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
EXOSC9Q06265 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
EXOSC9Q06265 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
EXOSC9Q06265 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
EXOSC9Q06265 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
EXOSC9Q06265 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
EXOSC9Q06265 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
EXOSC9Q06265 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
EXOSC9Q06265 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
EXOSC9Q06265 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
EXOSC9Q06265 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
EXOSC9Q06265 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
EXOSC9Q06265 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.57
EXOSC9Q06265 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
EXOSC9Q06265 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
EXOSC9Q06265 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
EXOSC9Q06265 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
EXOSC9Q06265 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
EXOSC9Q06265 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
EXOSC9Q06265 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
EXOSC9Q06265 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
EXOSC9Q06265 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
EXOSC9Q06265 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
EXOSC9Q06265 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
EXOSC9Q06265 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
EXOSC9Q06265 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
EXOSC9Q06265 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
EXOSC9Q06265 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
EXOSC9Q06265 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
EXOSC9Q06265 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
EXOSC9Q06265 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
EXOSC9Q06265 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
EXOSC9Q06265 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
EXOSC9Q06265 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
EXOSC9Q06265 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.57
EXOSC9Q06265 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
EXOSC9Q06265 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
EXOSC9Q06265 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
EXOSC9Q06265 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
EXOSC9Q06265 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
EXOSC9Q06265 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
EXOSC9Q06265 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
EXOSC9Q06265 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
EXOSC9Q06265 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
EXOSC9Q06265 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
EXOSC9Q06265 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
EXOSC9Q06265 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
EXOSC9Q06265 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
EXOSC9Q06265 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
EXOSC9Q06265 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
EXOSC9Q06265 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
EXOSC9Q06265 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
EXOSC9Q06265 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
EXOSC9Q06265 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
EXOSC9Q06265 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
EXOSC9Q06265 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
EXOSC9Q06265 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
EXOSC9Q06265 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
EXOSC9Q06265 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
EXOSC9Q06265 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
EXOSC9Q06265 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
EXOSC9Q06265 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
EXOSC9Q06265 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
EXOSC9Q06265 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
EXOSC9Q06265 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC31■■■□□ 2.55
EXOSC9Q06265 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
EXOSC9Q06265 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
EXOSC9Q06265 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
EXOSC9Q06265 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
EXOSC9Q06265 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
EXOSC9Q06265 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
EXOSC9Q06265 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
EXOSC9Q06265 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
EXOSC9Q06265 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
EXOSC9Q06265 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC30.99■■■□□ 2.55
EXOSC9Q06265 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
EXOSC9Q06265 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
EXOSC9Q06265 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
EXOSC9Q06265 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
EXOSC9Q06265 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
EXOSC9Q06265 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC30.97■■■□□ 2.55
EXOSC9Q06265 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
EXOSC9Q06265 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
EXOSC9Q06265 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
EXOSC9Q06265 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
EXOSC9Q06265 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
EXOSC9Q06265 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
EXOSC9Q06265 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
EXOSC9Q06265 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
EXOSC9Q06265 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
EXOSC9Q06265 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
EXOSC9Q06265 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
EXOSC9Q06265 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
EXOSC9Q06265 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
EXOSC9Q06265 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
EXOSC9Q06265 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms