Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
E2F1Q01094 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
E2F1Q01094 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
E2F1Q01094 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
E2F1Q01094 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
E2F1Q01094 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
E2F1Q01094 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
E2F1Q01094 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
E2F1Q01094 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
E2F1Q01094 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
E2F1Q01094 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
E2F1Q01094 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
E2F1Q01094 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
E2F1Q01094 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
E2F1Q01094 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
E2F1Q01094 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
E2F1Q01094 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
E2F1Q01094 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
E2F1Q01094 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
E2F1Q01094 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
E2F1Q01094 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
E2F1Q01094 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
E2F1Q01094 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
E2F1Q01094 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
E2F1Q01094 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
E2F1Q01094 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
E2F1Q01094 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
E2F1Q01094 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
E2F1Q01094 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
E2F1Q01094 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
E2F1Q01094 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
E2F1Q01094 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
E2F1Q01094 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
E2F1Q01094 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
E2F1Q01094 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
E2F1Q01094 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
E2F1Q01094 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
E2F1Q01094 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
E2F1Q01094 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
E2F1Q01094 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
E2F1Q01094 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
E2F1Q01094 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
E2F1Q01094 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
E2F1Q01094 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
E2F1Q01094 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
E2F1Q01094 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
E2F1Q01094 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
E2F1Q01094 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
E2F1Q01094 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
E2F1Q01094 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
E2F1Q01094 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
E2F1Q01094 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
E2F1Q01094 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
E2F1Q01094 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
E2F1Q01094 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
E2F1Q01094 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
E2F1Q01094 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
E2F1Q01094 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
E2F1Q01094 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
E2F1Q01094 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
E2F1Q01094 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
E2F1Q01094 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
E2F1Q01094 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
E2F1Q01094 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
E2F1Q01094 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
E2F1Q01094 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
E2F1Q01094 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
E2F1Q01094 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
E2F1Q01094 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
E2F1Q01094 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
E2F1Q01094 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
E2F1Q01094 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
E2F1Q01094 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
E2F1Q01094 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
E2F1Q01094 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
E2F1Q01094 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
E2F1Q01094 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
E2F1Q01094 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
E2F1Q01094 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
E2F1Q01094 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
E2F1Q01094 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
E2F1Q01094 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
E2F1Q01094 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
E2F1Q01094 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
E2F1Q01094 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
E2F1Q01094 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
E2F1Q01094 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
E2F1Q01094 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
E2F1Q01094 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
E2F1Q01094 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
E2F1Q01094 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
E2F1Q01094 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
E2F1Q01094 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
E2F1Q01094 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
E2F1Q01094 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
E2F1Q01094 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
E2F1Q01094 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
E2F1Q01094 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
E2F1Q01094 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
E2F1Q01094 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms