Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TFAMQ00059 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TFAMQ00059 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TFAMQ00059 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TFAMQ00059 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TFAMQ00059 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TFAMQ00059 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TFAMQ00059 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TFAMQ00059 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TFAMQ00059 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TFAMQ00059 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TFAMQ00059 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TFAMQ00059 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TFAMQ00059 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TFAMQ00059 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TFAMQ00059 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TFAMQ00059 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TFAMQ00059 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TFAMQ00059 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TFAMQ00059 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TFAMQ00059 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TFAMQ00059 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TFAMQ00059 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TFAMQ00059 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TFAMQ00059 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TFAMQ00059 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TFAMQ00059 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TFAMQ00059 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.76
TFAMQ00059 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TFAMQ00059 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TFAMQ00059 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TFAMQ00059 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TFAMQ00059 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TFAMQ00059 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TFAMQ00059 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TFAMQ00059 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
TFAMQ00059 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TFAMQ00059 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TFAMQ00059 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TFAMQ00059 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TFAMQ00059 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TFAMQ00059 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TFAMQ00059 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TFAMQ00059 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TFAMQ00059 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TFAMQ00059 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TFAMQ00059 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TFAMQ00059 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TFAMQ00059 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TFAMQ00059 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TFAMQ00059 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TFAMQ00059 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TFAMQ00059 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TFAMQ00059 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TFAMQ00059 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TFAMQ00059 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TFAMQ00059 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TFAMQ00059 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TFAMQ00059 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TFAMQ00059 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TFAMQ00059 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TFAMQ00059 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TFAMQ00059 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TFAMQ00059 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TFAMQ00059 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TFAMQ00059 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TFAMQ00059 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TFAMQ00059 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TFAMQ00059 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TFAMQ00059 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TFAMQ00059 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TFAMQ00059 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TFAMQ00059 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TFAMQ00059 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TFAMQ00059 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TFAMQ00059 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TFAMQ00059 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TFAMQ00059 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TFAMQ00059 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TFAMQ00059 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TFAMQ00059 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TFAMQ00059 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TFAMQ00059 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TFAMQ00059 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TFAMQ00059 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TFAMQ00059 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TFAMQ00059 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TFAMQ00059 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TFAMQ00059 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TFAMQ00059 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TFAMQ00059 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TFAMQ00059 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TFAMQ00059 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TFAMQ00059 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TFAMQ00059 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TFAMQ00059 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TFAMQ00059 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TFAMQ00059 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TFAMQ00059 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TFAMQ00059 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.2 ms