Protein–RNA interactions for Protein: Q00005

PPP2R2B, Serine/threonine-protein phosphatase 2A 55 kDa regulatory subunit B beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP2R2BQ00005 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP2R2BQ00005 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP2R2BQ00005 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP2R2BQ00005 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP2R2BQ00005 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP2R2BQ00005 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP2R2BQ00005 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP2R2BQ00005 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP2R2BQ00005 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP2R2BQ00005 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP2R2BQ00005 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP2R2BQ00005 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP2R2BQ00005 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP2R2BQ00005 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP2R2BQ00005 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP2R2BQ00005 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP2R2BQ00005 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP2R2BQ00005 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP2R2BQ00005 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP2R2BQ00005 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP2R2BQ00005 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPP2R2BQ00005 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPP2R2BQ00005 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPP2R2BQ00005 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPP2R2BQ00005 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPP2R2BQ00005 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPP2R2BQ00005 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPP2R2BQ00005 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPP2R2BQ00005 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPP2R2BQ00005 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPP2R2BQ00005 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPP2R2BQ00005 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPP2R2BQ00005 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPP2R2BQ00005 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPP2R2BQ00005 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPP2R2BQ00005 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPP2R2BQ00005 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPP2R2BQ00005 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPP2R2BQ00005 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PPP2R2BQ00005 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PPP2R2BQ00005 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PPP2R2BQ00005 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPP2R2BQ00005 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPP2R2BQ00005 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPP2R2BQ00005 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPP2R2BQ00005 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPP2R2BQ00005 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPP2R2BQ00005 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPP2R2BQ00005 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPP2R2BQ00005 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PPP2R2BQ00005 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPP2R2BQ00005 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPP2R2BQ00005 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPP2R2BQ00005 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PPP2R2BQ00005 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPP2R2BQ00005 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPP2R2BQ00005 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPP2R2BQ00005 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPP2R2BQ00005 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPP2R2BQ00005 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PPP2R2BQ00005 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPP2R2BQ00005 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PPP2R2BQ00005 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PPP2R2BQ00005 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PPP2R2BQ00005 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPP2R2BQ00005 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPP2R2BQ00005 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPP2R2BQ00005 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPP2R2BQ00005 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPP2R2BQ00005 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPP2R2BQ00005 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPP2R2BQ00005 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPP2R2BQ00005 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPP2R2BQ00005 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPP2R2BQ00005 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPP2R2BQ00005 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPP2R2BQ00005 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPP2R2BQ00005 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPP2R2BQ00005 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPP2R2BQ00005 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPP2R2BQ00005 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPP2R2BQ00005 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPP2R2BQ00005 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPP2R2BQ00005 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPP2R2BQ00005 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPP2R2BQ00005 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPP2R2BQ00005 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPP2R2BQ00005 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPP2R2BQ00005 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPP2R2BQ00005 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPP2R2BQ00005 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPP2R2BQ00005 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPP2R2BQ00005 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPP2R2BQ00005 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PPP2R2BQ00005 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPP2R2BQ00005 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPP2R2BQ00005 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPP2R2BQ00005 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPP2R2BQ00005 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPP2R2BQ00005 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms