Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATP2C1P98194 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATP2C1P98194 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
ATP2C1P98194 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATP2C1P98194 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATP2C1P98194 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATP2C1P98194 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATP2C1P98194 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATP2C1P98194 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATP2C1P98194 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATP2C1P98194 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATP2C1P98194 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATP2C1P98194 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATP2C1P98194 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATP2C1P98194 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATP2C1P98194 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
ATP2C1P98194 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATP2C1P98194 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATP2C1P98194 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATP2C1P98194 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP2C1P98194 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP2C1P98194 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP2C1P98194 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP2C1P98194 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP2C1P98194 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP2C1P98194 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ATP2C1P98194 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ATP2C1P98194 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ATP2C1P98194 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATP2C1P98194 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATP2C1P98194 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATP2C1P98194 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATP2C1P98194 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATP2C1P98194 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP2C1P98194 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP2C1P98194 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP2C1P98194 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP2C1P98194 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP2C1P98194 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP2C1P98194 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP2C1P98194 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATP2C1P98194 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATP2C1P98194 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATP2C1P98194 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATP2C1P98194 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATP2C1P98194 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATP2C1P98194 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATP2C1P98194 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATP2C1P98194 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
ATP2C1P98194 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP2C1P98194 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP2C1P98194 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP2C1P98194 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP2C1P98194 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP2C1P98194 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP2C1P98194 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP2C1P98194 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP2C1P98194 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP2C1P98194 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP2C1P98194 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP2C1P98194 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP2C1P98194 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP2C1P98194 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATP2C1P98194 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATP2C1P98194 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATP2C1P98194 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATP2C1P98194 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATP2C1P98194 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
ATP2C1P98194 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATP2C1P98194 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATP2C1P98194 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATP2C1P98194 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATP2C1P98194 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATP2C1P98194 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATP2C1P98194 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATP2C1P98194 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ATP2C1P98194 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ATP2C1P98194 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ATP2C1P98194 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ATP2C1P98194 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP2C1P98194 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP2C1P98194 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP2C1P98194 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP2C1P98194 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP2C1P98194 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP2C1P98194 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP2C1P98194 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP2C1P98194 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATP2C1P98194 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATP2C1P98194 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATP2C1P98194 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATP2C1P98194 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATP2C1P98194 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP2C1P98194 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP2C1P98194 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP2C1P98194 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP2C1P98194 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP2C1P98194 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP2C1P98194 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP2C1P98194 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms