Protein–RNA interactions for Protein: P82673

MRPS35, 28S ribosomal protein S35, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS35P82673 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MRPS35P82673 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
MRPS35P82673 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
MRPS35P82673 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MRPS35P82673 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MRPS35P82673 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MRPS35P82673 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MRPS35P82673 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MRPS35P82673 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MRPS35P82673 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MRPS35P82673 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MRPS35P82673 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MRPS35P82673 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MRPS35P82673 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MRPS35P82673 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MRPS35P82673 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MRPS35P82673 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MRPS35P82673 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MRPS35P82673 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MRPS35P82673 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MRPS35P82673 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MRPS35P82673 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MRPS35P82673 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MRPS35P82673 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MRPS35P82673 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MRPS35P82673 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MRPS35P82673 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MRPS35P82673 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MRPS35P82673 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MRPS35P82673 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MRPS35P82673 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MRPS35P82673 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MRPS35P82673 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MRPS35P82673 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MRPS35P82673 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MRPS35P82673 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MRPS35P82673 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MRPS35P82673 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MRPS35P82673 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MRPS35P82673 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MRPS35P82673 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MRPS35P82673 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MRPS35P82673 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
MRPS35P82673 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MRPS35P82673 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MRPS35P82673 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MRPS35P82673 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MRPS35P82673 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MRPS35P82673 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MRPS35P82673 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MRPS35P82673 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MRPS35P82673 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MRPS35P82673 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MRPS35P82673 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MRPS35P82673 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MRPS35P82673 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MRPS35P82673 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MRPS35P82673 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MRPS35P82673 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MRPS35P82673 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MRPS35P82673 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MRPS35P82673 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MRPS35P82673 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MRPS35P82673 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MRPS35P82673 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MRPS35P82673 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MRPS35P82673 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MRPS35P82673 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MRPS35P82673 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MRPS35P82673 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MRPS35P82673 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MRPS35P82673 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MRPS35P82673 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MRPS35P82673 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MRPS35P82673 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MRPS35P82673 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MRPS35P82673 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MRPS35P82673 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MRPS35P82673 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
MRPS35P82673 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MRPS35P82673 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MRPS35P82673 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MRPS35P82673 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MRPS35P82673 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MRPS35P82673 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MRPS35P82673 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MRPS35P82673 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MRPS35P82673 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MRPS35P82673 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MRPS35P82673 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MRPS35P82673 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MRPS35P82673 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MRPS35P82673 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MRPS35P82673 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MRPS35P82673 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MRPS35P82673 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MRPS35P82673 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MRPS35P82673 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MRPS35P82673 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MRPS35P82673 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms