Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSNK2A1P68400 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSNK2A1P68400 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSNK2A1P68400 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CSNK2A1P68400 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSNK2A1P68400 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CSNK2A1P68400 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSNK2A1P68400 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSNK2A1P68400 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSNK2A1P68400 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSNK2A1P68400 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSNK2A1P68400 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSNK2A1P68400 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSNK2A1P68400 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSNK2A1P68400 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSNK2A1P68400 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSNK2A1P68400 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSNK2A1P68400 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CSNK2A1P68400 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSNK2A1P68400 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSNK2A1P68400 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSNK2A1P68400 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CSNK2A1P68400 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSNK2A1P68400 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSNK2A1P68400 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CSNK2A1P68400 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSNK2A1P68400 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CSNK2A1P68400 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CSNK2A1P68400 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CSNK2A1P68400 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CSNK2A1P68400 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CSNK2A1P68400 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CSNK2A1P68400 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CSNK2A1P68400 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSNK2A1P68400 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSNK2A1P68400 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSNK2A1P68400 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSNK2A1P68400 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CSNK2A1P68400 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSNK2A1P68400 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSNK2A1P68400 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSNK2A1P68400 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSNK2A1P68400 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSNK2A1P68400 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSNK2A1P68400 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSNK2A1P68400 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSNK2A1P68400 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSNK2A1P68400 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSNK2A1P68400 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSNK2A1P68400 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSNK2A1P68400 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSNK2A1P68400 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CSNK2A1P68400 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSNK2A1P68400 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSNK2A1P68400 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSNK2A1P68400 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSNK2A1P68400 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSNK2A1P68400 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSNK2A1P68400 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSNK2A1P68400 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSNK2A1P68400 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSNK2A1P68400 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CSNK2A1P68400 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSNK2A1P68400 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSNK2A1P68400 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSNK2A1P68400 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSNK2A1P68400 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSNK2A1P68400 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSNK2A1P68400 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSNK2A1P68400 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSNK2A1P68400 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSNK2A1P68400 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CSNK2A1P68400 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSNK2A1P68400 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSNK2A1P68400 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSNK2A1P68400 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSNK2A1P68400 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSNK2A1P68400 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CSNK2A1P68400 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CSNK2A1P68400 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CSNK2A1P68400 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSNK2A1P68400 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSNK2A1P68400 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSNK2A1P68400 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSNK2A1P68400 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSNK2A1P68400 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSNK2A1P68400 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSNK2A1P68400 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSNK2A1P68400 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSNK2A1P68400 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSNK2A1P68400 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CSNK2A1P68400 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSNK2A1P68400 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CSNK2A1P68400 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSNK2A1P68400 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSNK2A1P68400 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSNK2A1P68400 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSNK2A1P68400 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CSNK2A1P68400 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSNK2A1P68400 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms