Protein–RNA interactions for Protein: P62877

RBX1, E3 ubiquitin-protein ligase RBX1, humanhuman

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBX1P62877 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RBX1P62877 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RBX1P62877 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RBX1P62877 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RBX1P62877 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RBX1P62877 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RBX1P62877 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBX1P62877 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBX1P62877 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBX1P62877 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBX1P62877 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBX1P62877 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBX1P62877 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBX1P62877 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBX1P62877 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBX1P62877 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBX1P62877 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBX1P62877 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RBX1P62877 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBX1P62877 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RBX1P62877 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBX1P62877 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBX1P62877 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBX1P62877 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBX1P62877 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBX1P62877 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBX1P62877 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBX1P62877 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBX1P62877 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBX1P62877 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBX1P62877 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBX1P62877 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBX1P62877 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBX1P62877 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBX1P62877 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBX1P62877 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBX1P62877 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBX1P62877 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBX1P62877 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBX1P62877 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBX1P62877 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBX1P62877 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBX1P62877 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBX1P62877 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBX1P62877 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBX1P62877 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RBX1P62877 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBX1P62877 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBX1P62877 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBX1P62877 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RBX1P62877 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBX1P62877 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBX1P62877 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBX1P62877 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBX1P62877 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBX1P62877 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBX1P62877 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBX1P62877 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBX1P62877 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBX1P62877 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBX1P62877 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBX1P62877 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBX1P62877 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBX1P62877 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBX1P62877 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RBX1P62877 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBX1P62877 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBX1P62877 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBX1P62877 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBX1P62877 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBX1P62877 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RBX1P62877 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBX1P62877 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBX1P62877 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBX1P62877 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBX1P62877 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBX1P62877 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBX1P62877 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RBX1P62877 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBX1P62877 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBX1P62877 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBX1P62877 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBX1P62877 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBX1P62877 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RBX1P62877 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBX1P62877 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBX1P62877 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBX1P62877 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBX1P62877 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBX1P62877 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBX1P62877 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBX1P62877 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBX1P62877 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBX1P62877 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBX1P62877 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RBX1P62877 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RBX1P62877 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RBX1P62877 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RBX1P62877 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RBX1P62877 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms