Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL23P62829 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL23P62829 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL23P62829 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL23P62829 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL23P62829 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL23P62829 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL23P62829 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL23P62829 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL23P62829 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL23P62829 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL23P62829 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL23P62829 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL23P62829 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL23P62829 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL23P62829 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL23P62829 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL23P62829 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL23P62829 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL23P62829 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL23P62829 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL23P62829 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL23P62829 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL23P62829 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL23P62829 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL23P62829 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL23P62829 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL23P62829 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL23P62829 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL23P62829 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL23P62829 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL23P62829 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL23P62829 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL23P62829 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL23P62829 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL23P62829 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL23P62829 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL23P62829 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL23P62829 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL23P62829 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL23P62829 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL23P62829 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL23P62829 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL23P62829 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL23P62829 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL23P62829 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPL23P62829 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPL23P62829 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPL23P62829 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPL23P62829 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPL23P62829 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPL23P62829 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPL23P62829 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPL23P62829 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPL23P62829 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPL23P62829 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPL23P62829 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPL23P62829 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPL23P62829 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPL23P62829 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPL23P62829 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPL23P62829 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPL23P62829 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPL23P62829 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPL23P62829 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPL23P62829 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPL23P62829 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPL23P62829 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPL23P62829 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPL23P62829 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL23P62829 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL23P62829 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL23P62829 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL23P62829 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL23P62829 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL23P62829 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL23P62829 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL23P62829 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL23P62829 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL23P62829 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL23P62829 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL23P62829 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL23P62829 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL23P62829 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL23P62829 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL23P62829 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL23P62829 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL23P62829 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL23P62829 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL23P62829 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL23P62829 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL23P62829 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL23P62829 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL23P62829 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL23P62829 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL23P62829 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL23P62829 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL23P62829 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL23P62829 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL23P62829 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.4 ms