Protein–RNA interactions for Protein: P62304

SNRPE, Small nuclear ribonucleoprotein E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPEP62304 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNRPEP62304 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNRPEP62304 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNRPEP62304 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNRPEP62304 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNRPEP62304 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNRPEP62304 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNRPEP62304 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNRPEP62304 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNRPEP62304 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNRPEP62304 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNRPEP62304 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNRPEP62304 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNRPEP62304 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNRPEP62304 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNRPEP62304 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNRPEP62304 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNRPEP62304 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNRPEP62304 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNRPEP62304 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNRPEP62304 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNRPEP62304 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNRPEP62304 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNRPEP62304 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNRPEP62304 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNRPEP62304 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNRPEP62304 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNRPEP62304 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNRPEP62304 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNRPEP62304 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNRPEP62304 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNRPEP62304 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNRPEP62304 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNRPEP62304 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNRPEP62304 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNRPEP62304 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNRPEP62304 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SNRPEP62304 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNRPEP62304 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNRPEP62304 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNRPEP62304 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNRPEP62304 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNRPEP62304 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNRPEP62304 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNRPEP62304 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNRPEP62304 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNRPEP62304 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNRPEP62304 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNRPEP62304 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNRPEP62304 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNRPEP62304 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNRPEP62304 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNRPEP62304 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNRPEP62304 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNRPEP62304 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNRPEP62304 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNRPEP62304 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNRPEP62304 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNRPEP62304 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNRPEP62304 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNRPEP62304 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNRPEP62304 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNRPEP62304 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNRPEP62304 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SNRPEP62304 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNRPEP62304 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNRPEP62304 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNRPEP62304 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNRPEP62304 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNRPEP62304 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNRPEP62304 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNRPEP62304 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNRPEP62304 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNRPEP62304 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNRPEP62304 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNRPEP62304 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNRPEP62304 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNRPEP62304 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNRPEP62304 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNRPEP62304 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNRPEP62304 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SNRPEP62304 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNRPEP62304 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNRPEP62304 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNRPEP62304 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNRPEP62304 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNRPEP62304 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNRPEP62304 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNRPEP62304 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNRPEP62304 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNRPEP62304 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNRPEP62304 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNRPEP62304 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNRPEP62304 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNRPEP62304 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNRPEP62304 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNRPEP62304 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNRPEP62304 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNRPEP62304 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNRPEP62304 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms