Protein–RNA interactions for Protein: P62191

PSMC1, 26S proteasome regulatory subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC1P62191 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PSMC1P62191 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PSMC1P62191 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PSMC1P62191 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PSMC1P62191 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PSMC1P62191 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PSMC1P62191 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PSMC1P62191 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PSMC1P62191 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PSMC1P62191 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PSMC1P62191 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PSMC1P62191 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PSMC1P62191 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSMC1P62191 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSMC1P62191 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSMC1P62191 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSMC1P62191 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PSMC1P62191 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PSMC1P62191 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PSMC1P62191 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PSMC1P62191 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PSMC1P62191 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PSMC1P62191 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PSMC1P62191 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PSMC1P62191 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PSMC1P62191 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PSMC1P62191 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PSMC1P62191 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PSMC1P62191 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PSMC1P62191 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PSMC1P62191 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PSMC1P62191 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PSMC1P62191 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PSMC1P62191 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PSMC1P62191 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PSMC1P62191 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PSMC1P62191 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PSMC1P62191 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PSMC1P62191 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PSMC1P62191 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PSMC1P62191 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PSMC1P62191 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PSMC1P62191 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PSMC1P62191 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PSMC1P62191 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PSMC1P62191 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PSMC1P62191 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PSMC1P62191 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PSMC1P62191 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PSMC1P62191 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PSMC1P62191 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PSMC1P62191 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PSMC1P62191 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PSMC1P62191 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PSMC1P62191 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PSMC1P62191 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PSMC1P62191 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PSMC1P62191 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PSMC1P62191 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PSMC1P62191 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PSMC1P62191 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PSMC1P62191 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PSMC1P62191 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PSMC1P62191 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PSMC1P62191 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PSMC1P62191 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PSMC1P62191 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PSMC1P62191 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PSMC1P62191 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PSMC1P62191 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PSMC1P62191 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PSMC1P62191 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PSMC1P62191 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PSMC1P62191 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PSMC1P62191 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PSMC1P62191 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PSMC1P62191 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PSMC1P62191 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PSMC1P62191 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PSMC1P62191 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PSMC1P62191 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PSMC1P62191 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PSMC1P62191 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PSMC1P62191 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PSMC1P62191 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PSMC1P62191 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PSMC1P62191 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PSMC1P62191 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PSMC1P62191 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PSMC1P62191 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PSMC1P62191 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PSMC1P62191 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PSMC1P62191 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PSMC1P62191 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PSMC1P62191 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PSMC1P62191 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PSMC1P62191 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PSMC1P62191 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PSMC1P62191 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PSMC1P62191 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms