Protein–RNA interactions for Protein: P61966

AP1S1, AP-1 complex subunit sigma-1A, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1S1P61966 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
AP1S1P61966 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AP1S1P61966 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AP1S1P61966 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AP1S1P61966 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AP1S1P61966 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AP1S1P61966 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AP1S1P61966 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AP1S1P61966 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AP1S1P61966 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AP1S1P61966 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AP1S1P61966 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AP1S1P61966 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AP1S1P61966 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AP1S1P61966 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AP1S1P61966 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AP1S1P61966 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AP1S1P61966 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AP1S1P61966 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AP1S1P61966 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AP1S1P61966 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
AP1S1P61966 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AP1S1P61966 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AP1S1P61966 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AP1S1P61966 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AP1S1P61966 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AP1S1P61966 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AP1S1P61966 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
AP1S1P61966 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AP1S1P61966 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AP1S1P61966 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AP1S1P61966 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AP1S1P61966 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
AP1S1P61966 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AP1S1P61966 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AP1S1P61966 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AP1S1P61966 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AP1S1P61966 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AP1S1P61966 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AP1S1P61966 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
AP1S1P61966 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AP1S1P61966 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AP1S1P61966 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AP1S1P61966 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AP1S1P61966 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AP1S1P61966 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AP1S1P61966 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AP1S1P61966 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AP1S1P61966 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AP1S1P61966 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
AP1S1P61966 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AP1S1P61966 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AP1S1P61966 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AP1S1P61966 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AP1S1P61966 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AP1S1P61966 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
AP1S1P61966 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AP1S1P61966 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
AP1S1P61966 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AP1S1P61966 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AP1S1P61966 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AP1S1P61966 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AP1S1P61966 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AP1S1P61966 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AP1S1P61966 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AP1S1P61966 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AP1S1P61966 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
AP1S1P61966 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AP1S1P61966 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AP1S1P61966 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
AP1S1P61966 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AP1S1P61966 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AP1S1P61966 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AP1S1P61966 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AP1S1P61966 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
AP1S1P61966 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AP1S1P61966 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AP1S1P61966 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AP1S1P61966 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AP1S1P61966 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AP1S1P61966 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
AP1S1P61966 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
AP1S1P61966 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AP1S1P61966 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AP1S1P61966 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AP1S1P61966 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AP1S1P61966 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AP1S1P61966 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AP1S1P61966 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AP1S1P61966 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AP1S1P61966 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AP1S1P61966 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AP1S1P61966 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AP1S1P61966 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AP1S1P61966 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AP1S1P61966 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AP1S1P61966 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AP1S1P61966 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AP1S1P61966 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
AP1S1P61966 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms