Protein–RNA interactions for Protein: P56856

CLDN18, Claudin-18, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN18P56856 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN18P56856 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN18P56856 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN18P56856 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN18P56856 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN18P56856 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN18P56856 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN18P56856 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN18P56856 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN18P56856 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN18P56856 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN18P56856 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN18P56856 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLDN18P56856 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLDN18P56856 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLDN18P56856 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLDN18P56856 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CLDN18P56856 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLDN18P56856 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLDN18P56856 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLDN18P56856 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLDN18P56856 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLDN18P56856 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLDN18P56856 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLDN18P56856 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN18P56856 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN18P56856 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN18P56856 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN18P56856 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN18P56856 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN18P56856 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN18P56856 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN18P56856 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN18P56856 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN18P56856 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN18P56856 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN18P56856 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN18P56856 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDN18P56856 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDN18P56856 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDN18P56856 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDN18P56856 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDN18P56856 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDN18P56856 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDN18P56856 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDN18P56856 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDN18P56856 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDN18P56856 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDN18P56856 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDN18P56856 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDN18P56856 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDN18P56856 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDN18P56856 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDN18P56856 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDN18P56856 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLDN18P56856 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CLDN18P56856 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLDN18P56856 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLDN18P56856 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLDN18P56856 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLDN18P56856 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLDN18P56856 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLDN18P56856 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLDN18P56856 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLDN18P56856 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLDN18P56856 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CLDN18P56856 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLDN18P56856 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CLDN18P56856 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN18P56856 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN18P56856 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN18P56856 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN18P56856 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN18P56856 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN18P56856 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN18P56856 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN18P56856 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN18P56856 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN18P56856 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN18P56856 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN18P56856 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN18P56856 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN18P56856 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN18P56856 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN18P56856 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN18P56856 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN18P56856 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN18P56856 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN18P56856 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN18P56856 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN18P56856 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN18P56856 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN18P56856 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN18P56856 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN18P56856 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN18P56856 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN18P56856 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN18P56856 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN18P56856 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN18P56856 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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