Protein–RNA interactions for Protein: P55056

APOC4, Apolipoprotein C-IV, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4P55056 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOC4P55056 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOC4P55056 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOC4P55056 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOC4P55056 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOC4P55056 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOC4P55056 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOC4P55056 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOC4P55056 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOC4P55056 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOC4P55056 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOC4P55056 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOC4P55056 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOC4P55056 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOC4P55056 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOC4P55056 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOC4P55056 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOC4P55056 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOC4P55056 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOC4P55056 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOC4P55056 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOC4P55056 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOC4P55056 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOC4P55056 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOC4P55056 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOC4P55056 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOC4P55056 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOC4P55056 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOC4P55056 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOC4P55056 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOC4P55056 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOC4P55056 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
APOC4P55056 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOC4P55056 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOC4P55056 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOC4P55056 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOC4P55056 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOC4P55056 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOC4P55056 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOC4P55056 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOC4P55056 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOC4P55056 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOC4P55056 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOC4P55056 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOC4P55056 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOC4P55056 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOC4P55056 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOC4P55056 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOC4P55056 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
APOC4P55056 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOC4P55056 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOC4P55056 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOC4P55056 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOC4P55056 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOC4P55056 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOC4P55056 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
APOC4P55056 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOC4P55056 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
APOC4P55056 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOC4P55056 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOC4P55056 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOC4P55056 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOC4P55056 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOC4P55056 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOC4P55056 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOC4P55056 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOC4P55056 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOC4P55056 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOC4P55056 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOC4P55056 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOC4P55056 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOC4P55056 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOC4P55056 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOC4P55056 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOC4P55056 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOC4P55056 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
APOC4P55056 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOC4P55056 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOC4P55056 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOC4P55056 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOC4P55056 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOC4P55056 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOC4P55056 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOC4P55056 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOC4P55056 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOC4P55056 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOC4P55056 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOC4P55056 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOC4P55056 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOC4P55056 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOC4P55056 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOC4P55056 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOC4P55056 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOC4P55056 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOC4P55056 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
APOC4P55056 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOC4P55056 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
APOC4P55056 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOC4P55056 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOC4P55056 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms