Protein–RNA interactions for Protein: P54219

SLC18A1, Chromaffin granule amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A1P54219 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC18A1P54219 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC18A1P54219 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC18A1P54219 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC18A1P54219 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC18A1P54219 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC18A1P54219 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC18A1P54219 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC18A1P54219 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC18A1P54219 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC18A1P54219 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC18A1P54219 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC18A1P54219 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC18A1P54219 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC18A1P54219 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC18A1P54219 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC18A1P54219 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC18A1P54219 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC18A1P54219 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC18A1P54219 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC18A1P54219 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC18A1P54219 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC18A1P54219 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC18A1P54219 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC18A1P54219 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC18A1P54219 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC18A1P54219 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC18A1P54219 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC18A1P54219 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC18A1P54219 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC18A1P54219 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC18A1P54219 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC18A1P54219 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC18A1P54219 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC18A1P54219 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC18A1P54219 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC18A1P54219 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC18A1P54219 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC18A1P54219 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC18A1P54219 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC18A1P54219 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC18A1P54219 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC18A1P54219 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC18A1P54219 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SLC18A1P54219 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SLC18A1P54219 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SLC18A1P54219 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC18A1P54219 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC18A1P54219 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC18A1P54219 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC18A1P54219 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC18A1P54219 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC18A1P54219 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC18A1P54219 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC18A1P54219 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC18A1P54219 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC18A1P54219 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC18A1P54219 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC18A1P54219 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC18A1P54219 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC18A1P54219 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC18A1P54219 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC18A1P54219 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC18A1P54219 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC18A1P54219 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC18A1P54219 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC18A1P54219 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC18A1P54219 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC18A1P54219 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC18A1P54219 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC18A1P54219 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC18A1P54219 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC18A1P54219 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC18A1P54219 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC18A1P54219 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC18A1P54219 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC18A1P54219 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC18A1P54219 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC18A1P54219 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC18A1P54219 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC18A1P54219 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC18A1P54219 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC18A1P54219 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC18A1P54219 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC18A1P54219 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC18A1P54219 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC18A1P54219 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC18A1P54219 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC18A1P54219 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC18A1P54219 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC18A1P54219 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC18A1P54219 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC18A1P54219 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC18A1P54219 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC18A1P54219 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC18A1P54219 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC18A1P54219 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC18A1P54219 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC18A1P54219 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC18A1P54219 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.9 ms