Protein–RNA interactions for Protein: P48728

AMT, Aminomethyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMTP48728 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AMTP48728 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AMTP48728 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AMTP48728 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AMTP48728 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AMTP48728 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AMTP48728 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AMTP48728 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
AMTP48728 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AMTP48728 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AMTP48728 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
AMTP48728 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AMTP48728 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AMTP48728 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AMTP48728 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AMTP48728 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
AMTP48728 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AMTP48728 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AMTP48728 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AMTP48728 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AMTP48728 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AMTP48728 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AMTP48728 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AMTP48728 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AMTP48728 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AMTP48728 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AMTP48728 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
AMTP48728 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AMTP48728 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
AMTP48728 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AMTP48728 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
AMTP48728 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AMTP48728 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AMTP48728 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AMTP48728 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
AMTP48728 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AMTP48728 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AMTP48728 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AMTP48728 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
AMTP48728 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
AMTP48728 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
AMTP48728 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AMTP48728 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AMTP48728 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
AMTP48728 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AMTP48728 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AMTP48728 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
AMTP48728 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AMTP48728 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AMTP48728 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AMTP48728 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AMTP48728 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AMTP48728 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AMTP48728 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
AMTP48728 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AMTP48728 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AMTP48728 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
AMTP48728 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AMTP48728 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
AMTP48728 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AMTP48728 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AMTP48728 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AMTP48728 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AMTP48728 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AMTP48728 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
AMTP48728 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
AMTP48728 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AMTP48728 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
AMTP48728 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AMTP48728 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AMTP48728 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AMTP48728 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AMTP48728 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
AMTP48728 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AMTP48728 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AMTP48728 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AMTP48728 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AMTP48728 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AMTP48728 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
AMTP48728 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AMTP48728 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
AMTP48728 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AMTP48728 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AMTP48728 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AMTP48728 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AMTP48728 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AMTP48728 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AMTP48728 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AMTP48728 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AMTP48728 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AMTP48728 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AMTP48728 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AMTP48728 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AMTP48728 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AMTP48728 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AMTP48728 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AMTP48728 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AMTP48728 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AMTP48728 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AMTP48728 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms