Protein–RNA interactions for Protein: P43897

TSFM, Elongation factor Ts, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSFMP43897 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSFMP43897 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSFMP43897 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSFMP43897 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSFMP43897 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSFMP43897 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSFMP43897 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TSFMP43897 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSFMP43897 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSFMP43897 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSFMP43897 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSFMP43897 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TSFMP43897 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSFMP43897 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TSFMP43897 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSFMP43897 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSFMP43897 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSFMP43897 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TSFMP43897 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSFMP43897 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSFMP43897 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSFMP43897 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSFMP43897 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSFMP43897 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSFMP43897 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSFMP43897 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSFMP43897 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSFMP43897 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSFMP43897 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSFMP43897 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSFMP43897 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSFMP43897 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSFMP43897 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSFMP43897 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSFMP43897 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSFMP43897 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSFMP43897 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSFMP43897 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSFMP43897 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSFMP43897 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSFMP43897 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSFMP43897 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSFMP43897 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSFMP43897 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSFMP43897 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TSFMP43897 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSFMP43897 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSFMP43897 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSFMP43897 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TSFMP43897 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TSFMP43897 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TSFMP43897 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TSFMP43897 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TSFMP43897 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSFMP43897 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TSFMP43897 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TSFMP43897 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSFMP43897 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSFMP43897 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSFMP43897 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSFMP43897 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSFMP43897 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSFMP43897 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSFMP43897 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSFMP43897 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSFMP43897 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSFMP43897 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSFMP43897 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSFMP43897 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSFMP43897 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSFMP43897 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSFMP43897 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSFMP43897 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSFMP43897 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSFMP43897 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSFMP43897 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSFMP43897 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSFMP43897 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSFMP43897 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSFMP43897 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSFMP43897 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSFMP43897 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSFMP43897 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSFMP43897 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSFMP43897 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSFMP43897 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSFMP43897 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSFMP43897 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSFMP43897 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSFMP43897 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSFMP43897 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSFMP43897 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSFMP43897 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSFMP43897 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSFMP43897 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSFMP43897 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSFMP43897 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSFMP43897 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSFMP43897 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TSFMP43897 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms