Protein–RNA interactions for Protein: P42263

GRIA3, Glutamate receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA3P42263 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIA3P42263 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIA3P42263 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIA3P42263 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIA3P42263 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIA3P42263 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIA3P42263 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIA3P42263 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIA3P42263 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIA3P42263 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIA3P42263 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIA3P42263 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIA3P42263 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIA3P42263 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIA3P42263 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIA3P42263 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIA3P42263 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIA3P42263 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIA3P42263 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIA3P42263 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIA3P42263 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIA3P42263 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIA3P42263 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIA3P42263 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIA3P42263 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIA3P42263 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIA3P42263 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIA3P42263 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIA3P42263 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIA3P42263 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIA3P42263 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIA3P42263 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIA3P42263 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIA3P42263 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIA3P42263 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIA3P42263 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIA3P42263 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIA3P42263 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIA3P42263 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIA3P42263 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIA3P42263 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIA3P42263 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIA3P42263 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIA3P42263 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIA3P42263 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIA3P42263 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIA3P42263 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIA3P42263 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIA3P42263 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIA3P42263 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIA3P42263 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIA3P42263 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIA3P42263 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GRIA3P42263 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIA3P42263 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIA3P42263 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIA3P42263 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIA3P42263 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIA3P42263 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIA3P42263 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIA3P42263 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIA3P42263 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIA3P42263 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIA3P42263 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIA3P42263 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIA3P42263 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIA3P42263 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIA3P42263 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIA3P42263 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIA3P42263 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIA3P42263 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIA3P42263 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIA3P42263 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIA3P42263 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIA3P42263 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIA3P42263 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIA3P42263 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIA3P42263 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIA3P42263 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIA3P42263 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIA3P42263 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIA3P42263 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIA3P42263 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIA3P42263 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIA3P42263 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIA3P42263 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIA3P42263 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIA3P42263 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIA3P42263 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIA3P42263 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIA3P42263 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIA3P42263 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIA3P42263 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIA3P42263 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIA3P42263 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIA3P42263 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIA3P42263 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIA3P42263 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIA3P42263 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIA3P42263 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.9 ms