Protein–RNA interactions for Protein: P39086

GRIK1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK1P39086 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GRIK1P39086 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GRIK1P39086 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GRIK1P39086 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
GRIK1P39086 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
GRIK1P39086 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GRIK1P39086 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
GRIK1P39086 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GRIK1P39086 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GRIK1P39086 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GRIK1P39086 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GRIK1P39086 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GRIK1P39086 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
GRIK1P39086 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GRIK1P39086 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GRIK1P39086 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GRIK1P39086 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GRIK1P39086 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GRIK1P39086 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GRIK1P39086 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRIK1P39086 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRIK1P39086 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRIK1P39086 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRIK1P39086 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRIK1P39086 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRIK1P39086 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRIK1P39086 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRIK1P39086 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GRIK1P39086 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GRIK1P39086 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GRIK1P39086 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GRIK1P39086 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GRIK1P39086 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GRIK1P39086 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIK1P39086 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIK1P39086 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIK1P39086 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIK1P39086 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GRIK1P39086 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GRIK1P39086 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GRIK1P39086 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GRIK1P39086 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GRIK1P39086 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GRIK1P39086 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GRIK1P39086 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GRIK1P39086 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GRIK1P39086 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GRIK1P39086 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRIK1P39086 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRIK1P39086 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRIK1P39086 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRIK1P39086 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRIK1P39086 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRIK1P39086 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRIK1P39086 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRIK1P39086 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRIK1P39086 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRIK1P39086 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GRIK1P39086 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRIK1P39086 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRIK1P39086 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRIK1P39086 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRIK1P39086 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRIK1P39086 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRIK1P39086 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRIK1P39086 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRIK1P39086 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GRIK1P39086 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GRIK1P39086 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GRIK1P39086 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GRIK1P39086 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
GRIK1P39086 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GRIK1P39086 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GRIK1P39086 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GRIK1P39086 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GRIK1P39086 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GRIK1P39086 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GRIK1P39086 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
GRIK1P39086 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GRIK1P39086 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GRIK1P39086 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GRIK1P39086 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GRIK1P39086 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GRIK1P39086 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GRIK1P39086 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GRIK1P39086 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GRIK1P39086 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GRIK1P39086 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GRIK1P39086 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GRIK1P39086 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GRIK1P39086 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GRIK1P39086 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
GRIK1P39086 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GRIK1P39086 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GRIK1P39086 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GRIK1P39086 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIK1P39086 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIK1P39086 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIK1P39086 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GRIK1P39086 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101 ms