Protein–RNA interactions for Protein: P35908

KRT2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT2P35908 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KRT2P35908 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KRT2P35908 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KRT2P35908 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KRT2P35908 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KRT2P35908 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KRT2P35908 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KRT2P35908 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KRT2P35908 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KRT2P35908 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KRT2P35908 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KRT2P35908 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KRT2P35908 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KRT2P35908 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT2P35908 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT2P35908 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT2P35908 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT2P35908 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT2P35908 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT2P35908 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KRT2P35908 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KRT2P35908 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KRT2P35908 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
KRT2P35908 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KRT2P35908 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KRT2P35908 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KRT2P35908 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KRT2P35908 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KRT2P35908 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
KRT2P35908 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2
KRT2P35908 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
KRT2P35908 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
KRT2P35908 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
KRT2P35908 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KRT2P35908 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KRT2P35908 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KRT2P35908 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KRT2P35908 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
KRT2P35908 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KRT2P35908 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
KRT2P35908 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KRT2P35908 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KRT2P35908 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KRT2P35908 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KRT2P35908 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KRT2P35908 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KRT2P35908 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
KRT2P35908 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
KRT2P35908 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KRT2P35908 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
KRT2P35908 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KRT2P35908 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KRT2P35908 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KRT2P35908 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
KRT2P35908 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
KRT2P35908 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KRT2P35908 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
KRT2P35908 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KRT2P35908 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KRT2P35908 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
KRT2P35908 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
KRT2P35908 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KRT2P35908 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KRT2P35908 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KRT2P35908 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KRT2P35908 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KRT2P35908 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KRT2P35908 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
KRT2P35908 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KRT2P35908 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
KRT2P35908 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KRT2P35908 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KRT2P35908 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KRT2P35908 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KRT2P35908 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KRT2P35908 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
KRT2P35908 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KRT2P35908 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KRT2P35908 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KRT2P35908 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KRT2P35908 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KRT2P35908 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
KRT2P35908 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KRT2P35908 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KRT2P35908 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT2P35908 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT2P35908 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT2P35908 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT2P35908 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KRT2P35908 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KRT2P35908 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KRT2P35908 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KRT2P35908 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
KRT2P35908 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KRT2P35908 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
KRT2P35908 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KRT2P35908 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
KRT2P35908 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KRT2P35908 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KRT2P35908 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms