Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTNNB1P35222 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTNNB1P35222 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTNNB1P35222 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTNNB1P35222 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTNNB1P35222 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTNNB1P35222 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTNNB1P35222 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTNNB1P35222 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTNNB1P35222 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTNNB1P35222 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CTNNB1P35222 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CTNNB1P35222 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CTNNB1P35222 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CTNNB1P35222 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CTNNB1P35222 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CTNNB1P35222 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CTNNB1P35222 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CTNNB1P35222 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CTNNB1P35222 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTNNB1P35222 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTNNB1P35222 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTNNB1P35222 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTNNB1P35222 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTNNB1P35222 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTNNB1P35222 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTNNB1P35222 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTNNB1P35222 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTNNB1P35222 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTNNB1P35222 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTNNB1P35222 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTNNB1P35222 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTNNB1P35222 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTNNB1P35222 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTNNB1P35222 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTNNB1P35222 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTNNB1P35222 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTNNB1P35222 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTNNB1P35222 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTNNB1P35222 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTNNB1P35222 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTNNB1P35222 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTNNB1P35222 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTNNB1P35222 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTNNB1P35222 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTNNB1P35222 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CTNNB1P35222 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CTNNB1P35222 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CTNNB1P35222 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTNNB1P35222 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTNNB1P35222 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTNNB1P35222 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTNNB1P35222 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTNNB1P35222 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTNNB1P35222 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTNNB1P35222 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTNNB1P35222 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTNNB1P35222 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTNNB1P35222 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTNNB1P35222 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTNNB1P35222 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTNNB1P35222 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTNNB1P35222 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTNNB1P35222 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTNNB1P35222 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTNNB1P35222 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTNNB1P35222 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTNNB1P35222 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTNNB1P35222 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTNNB1P35222 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTNNB1P35222 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTNNB1P35222 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTNNB1P35222 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTNNB1P35222 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTNNB1P35222 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CTNNB1P35222 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTNNB1P35222 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTNNB1P35222 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTNNB1P35222 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTNNB1P35222 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTNNB1P35222 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CTNNB1P35222 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTNNB1P35222 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTNNB1P35222 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTNNB1P35222 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTNNB1P35222 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTNNB1P35222 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTNNB1P35222 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTNNB1P35222 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTNNB1P35222 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTNNB1P35222 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTNNB1P35222 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTNNB1P35222 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CTNNB1P35222 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CTNNB1P35222 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CTNNB1P35222 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CTNNB1P35222 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
CTNNB1P35222 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CTNNB1P35222 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CTNNB1P35222 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms