Protein–RNA interactions for Protein: P29375

KDM5A, Lysine-specific demethylase 5A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5AP29375 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
KDM5AP29375 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC35.1■■■■□ 3.21
KDM5AP29375 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
KDM5AP29375 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
KDM5AP29375 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
KDM5AP29375 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
KDM5AP29375 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
KDM5AP29375 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC35.08■■■■□ 3.21
KDM5AP29375 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
KDM5AP29375 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC35.08■■■■□ 3.21
KDM5AP29375 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
KDM5AP29375 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC35.07■■■■□ 3.2
KDM5AP29375 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
KDM5AP29375 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
KDM5AP29375 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
KDM5AP29375 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
KDM5AP29375 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
KDM5AP29375 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC35.05■■■■□ 3.2
KDM5AP29375 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
KDM5AP29375 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
KDM5AP29375 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
KDM5AP29375 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
KDM5AP29375 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
KDM5AP29375 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
KDM5AP29375 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
KDM5AP29375 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
KDM5AP29375 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
KDM5AP29375 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
KDM5AP29375 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC35.03■■■■□ 3.2
KDM5AP29375 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
KDM5AP29375 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
KDM5AP29375 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
KDM5AP29375 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
KDM5AP29375 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
KDM5AP29375 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
KDM5AP29375 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
KDM5AP29375 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
KDM5AP29375 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.19
KDM5AP29375 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
KDM5AP29375 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
KDM5AP29375 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.19
KDM5AP29375 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.19
KDM5AP29375 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.19
KDM5AP29375 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
KDM5AP29375 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC35■■■■□ 3.19
KDM5AP29375 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
KDM5AP29375 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
KDM5AP29375 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
KDM5AP29375 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
KDM5AP29375 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
KDM5AP29375 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
KDM5AP29375 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
KDM5AP29375 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
KDM5AP29375 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
KDM5AP29375 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
KDM5AP29375 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
KDM5AP29375 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
KDM5AP29375 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
KDM5AP29375 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
KDM5AP29375 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC34.96■■■■□ 3.19
KDM5AP29375 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
KDM5AP29375 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC34.96■■■■□ 3.19
KDM5AP29375 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
KDM5AP29375 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
KDM5AP29375 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
KDM5AP29375 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
KDM5AP29375 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
KDM5AP29375 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC34.95■■■■□ 3.18
KDM5AP29375 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
KDM5AP29375 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
KDM5AP29375 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC34.94■■■■□ 3.18
KDM5AP29375 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
KDM5AP29375 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
KDM5AP29375 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
KDM5AP29375 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
KDM5AP29375 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
KDM5AP29375 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
KDM5AP29375 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
KDM5AP29375 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
KDM5AP29375 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
KDM5AP29375 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
KDM5AP29375 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
KDM5AP29375 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
KDM5AP29375 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
KDM5AP29375 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
KDM5AP29375 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
KDM5AP29375 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
KDM5AP29375 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
KDM5AP29375 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
KDM5AP29375 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
KDM5AP29375 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
KDM5AP29375 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
KDM5AP29375 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
KDM5AP29375 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
KDM5AP29375 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
KDM5AP29375 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
KDM5AP29375 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
KDM5AP29375 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
KDM5AP29375 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC34.88■■■■□ 3.17
KDM5AP29375 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms