Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2E2P29084 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2E2P29084 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF2E2P29084 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF2E2P29084 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF2E2P29084 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF2E2P29084 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF2E2P29084 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2E2P29084 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2E2P29084 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2E2P29084 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2E2P29084 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2E2P29084 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2E2P29084 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2E2P29084 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2E2P29084 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2E2P29084 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2E2P29084 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2E2P29084 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2E2P29084 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2E2P29084 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2E2P29084 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2E2P29084 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2E2P29084 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2E2P29084 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2E2P29084 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2E2P29084 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2E2P29084 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2E2P29084 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2E2P29084 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2E2P29084 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2E2P29084 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2E2P29084 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2E2P29084 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2E2P29084 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2E2P29084 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2E2P29084 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2E2P29084 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2E2P29084 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2E2P29084 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2E2P29084 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2E2P29084 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2E2P29084 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2E2P29084 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
GTF2E2P29084 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GTF2E2P29084 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2E2P29084 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2E2P29084 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2E2P29084 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2E2P29084 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2E2P29084 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2E2P29084 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2E2P29084 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2E2P29084 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2E2P29084 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2E2P29084 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2E2P29084 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2E2P29084 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2E2P29084 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2E2P29084 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2E2P29084 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2E2P29084 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2E2P29084 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2E2P29084 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2E2P29084 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2E2P29084 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2E2P29084 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2E2P29084 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2E2P29084 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2E2P29084 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2E2P29084 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2E2P29084 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2E2P29084 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2E2P29084 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2E2P29084 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2E2P29084 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2E2P29084 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2E2P29084 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2E2P29084 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2E2P29084 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2E2P29084 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2E2P29084 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2E2P29084 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2E2P29084 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2E2P29084 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2E2P29084 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2E2P29084 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2E2P29084 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2E2P29084 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2E2P29084 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2E2P29084 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2E2P29084 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2E2P29084 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2E2P29084 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2E2P29084 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2E2P29084 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2E2P29084 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2E2P29084 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2E2P29084 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2E2P29084 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms